当前解析结果
SmilChr01G003092| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003092 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003092 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003092 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 49735087 - 49740054 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990003 |
|---|---|
| GeneID | 130990003 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990003 |
| 原始查询 | LOC130990003 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990003 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770172.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057770172.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057770172.1 |
| 4 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057770172.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770172.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:49735584 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C75 |
Chr1:49735588 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B113,B115,B39,B51,B75,C40,C42,C53,C55,C74,C9 |
Chr1:49735594 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 11 | B113,B115,B39,B51,B75,C40,C42,C53,C55,C74,C9 |
Chr1:49735623 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr1:49735629 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B106,C11,C69 |
Chr1:49735641 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B108,B49,B58,C23 |
Chr1:49735658 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr1:49735668 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 67 | A15,A18,A22,A24,A4,B1,B103,B105,B109,B115,B121,B123,B127,B129,B130,B136,B19,B3,B32,B34,B36,B37,B44,B45,B46,B47,B48,B50,B59,B61,B62,B66,B7,B77,B82,B85,B9,B91,B94,B97,C10,C19,C2,C26,C41,C43,C45,C51,C54,C55,C58,C60,C61,C63,C65,C70,C71,C74,C8,C81,C82,C9,D1,D11,D4,D7,D8 |
Chr1:49735669 |
CCG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 66 | A15,A18,A22,A24,A4,B1,B103,B105,B109,B115,B121,B123,B127,B129,B130,B136,B19,B3,B32,B34,B36,B37,B44,B45,B46,B47,B48,B50,B59,B61,B62,B66,B7,B77,B82,B85,B9,B91,B94,B97,C10,C19,C26,C41,C43,C45,C51,C54,C55,C58,C60,C61,C63,C65,C70,C71,C74,C8,C81,C82,C9,D1,D11,D4,D7,D8 |
Chr1:49735678 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C25,D6 |
Chr1:49735680 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr1:49735682 |
G |
GGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B19 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。