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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003295`

染色体: Chr06 坐标: 45490258-45491220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003295`
名称	SmilChr06G003295
描述	protein DOG1-like 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45490258 - 45491220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990011`
GeneID	`130990011`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990011`
原始查询	`LOC130990011`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DOG1-like 3
产物	protein DOG1-like 3
Arabidopsis	`AT3G14880` (AT3G14880) transcription factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820717] identity=36.1; qcov=0.902; evalue=7.62e-49; confidence=medium
Rice	`Os01g0159000` (OsDOG1L-2) - identity=52.2; qcov=0.569; evalue=2.86e-35; confidence=medium
GO	GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14144 (DOG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990011

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770180.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770180.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770180.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770180.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45490335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:45490417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:45490455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:45490521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,C42,C6,D11
`Chr6:45490557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:45490560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C42,D11
`Chr6:45490583`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A1
`Chr6:45490583`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A1
`Chr6:45490681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C74
`Chr6:45490715`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr6:45490715`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr6:45490780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770180.1

276 aa

138

276

DOG1

PF14144 DOG1 40-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770180.1`	Pfam	`PF14144`	DOG1	Family	40	119	2.5e-27	95.6	Seed dormancy control

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914197.1
ATGTCGACGTCCCCGCCCGACAGCCTCACATACTTGAGACATACAATTCGAAGCGGTCTCCGTGAAGGCGACTCTTTCGAGAAATTCTTCGAGCGCTGGATCGCAGAACAGAATCAGCACCTCGAAGAACTCGTGTCCGCCTCCAAGGAGGAGGAGGCGGCCCCGGACCGGGGGGTGCTACGGCCCCTGGTGAAGCGCGTGGTCCAGCATTACGAGCATTACTATAGGGCCAAGGGGCGGTGGGGCAAGACGGACATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990011
ATGTCGACGTCCCCGCCCGACAGCCTCACATACTTGAGACATACAATTCGAAGCGGTCTCCGTGAAGGCGACTCTTTCGAGAAATTCTTCGAGCGCTGGATCGCAGAACAGAATCAGCACCTCGAAGAACTCGTGTCCGCCTCCAAGGAGGAGGAGGCGGCCCCGGACCGGGGGGTGCTACGGCCCCTGGTGAAGCGCGTGGTCCAGCATTACGAGCATTACTATAGGGCCAAGGGGCGGTGGGGCAAGACGGACATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770180.1
MSTSPPDSLTYLRHTIRSGLREGDSFEKFFERWIAEQNQHLEELVSASKEEEAAPDRGVLRPLVKRVVQHYEHYYRAKGRWGKTDILAMLSPSWRSSLEDAFLWVGGWRPSMAFHLLYSKSGLQLEARLQELMQGLSTGDLGDLSATQLEQVDVLQKETIRKEQEITEKLAEQQETVADASMVELAHAMTEAEAMDVDVGQSRVDATLAPKQDALVGLLHMADQLRLNTLRKVIDILTPMQAVHYLIAAAALHLRIHEWG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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