当前解析结果
SmilChr06G000064| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000064 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000064 |
| 描述 | protein PELPK1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 520472 - 520786 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990023 |
|---|---|
| GeneID | 130990023 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990023 |
| 原始查询 | LOC130990023 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein PELPK1-like |
| 产物 | protein PELPK1-like |
| Arabidopsis | AT5G09520 (PELPK2)hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830811] identity=39.8; qcov=1.18; evalue=1.42e-11; confidence=low |
| Rice | Os07g0599700 (OJ1634_B10.115)- identity=58.7; qcov=0.606; evalue=9.69e-07; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990023 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057770209.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057770209.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057770209.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057770209.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770209.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:520493 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,B37 |
Chr6:520519 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr6:520554 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,D4 |
Chr6:520563 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B32,B8,B90 |
Chr6:520564 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr6:520570 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B3,C22,C59 |
Chr6:520578 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,B32 |
Chr6:520609 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr6:520702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B107,C37 |
Chr6:520784 |
C |
CAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | A24,B4,B99,D4 |
Chr6:520784 |
C |
CAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 4 | A24,B4,B99,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。