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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000252`

染色体: Chr06 坐标: 1671680-1672761 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000252`
名称	SmilChr06G000252
描述	uncharacterized SmilChr06G000252
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1671680 - 1672761 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990040`
GeneID	`130990040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990040`
原始查询	`LOC130990040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0100800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0100800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G24265` (AT1G24265) bZIP transcription factor, putative (DUF1664) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839041] identity=33.3; qcov=0.877; evalue=1.07e-10; confidence=low
Rice	`Os01g0100800` - identity=30.9; qcov=0.887; evalue=1.5e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07889 (DUF1664)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770223.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770223.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770223.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770223.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770223.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1671705`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A9,B17,B92,C19,C30
`Chr6:1671705`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A9,B17,B92,C19,C30
`Chr6:1671708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B92,C30
`Chr6:1671894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr6:1672051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:1672083`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B114,B47,B64,B72,B83,C17,C21,C4,C46,D1
`Chr6:1672114`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B1,B103,B111,B113,B15,B25,B6,B91
`Chr6:1672662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770223.1

106 aa

106

DUF1664

PF07889 DUF1664 1-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770223.1`	Pfam	`PF07889`	DUF1664	Coiled-coil	1	94	2.4e-22	80.0	Protein of unknown function (DUF1664)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914240.1
CTGGAAGATTTTTGATATGATGTTTGCAACAAGGGGTGGCTTAAATGATGCATGTTCTTCTGTAGCTAAACAGCTTGATAATGTTTACTCCTCCATTTCGGTTACTGAGAGAGATATGTCGTTGAAAATTCACCGAGTAGATTGTAAATATGATGTGGTTGCTGATAATACAACAGCAACGAAAGAGGAGGTGTCTGTACTGCGAGGTGATATGACATCGATTAGTTTAGAAATCGAGGATGTTACTCGTACAATTCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990040
ATGATGTTTGCAACAAGGGGTGGCTTAAATGATGCATGTTCTTCTGTAGCTAAACAGCTTGATAATGTTTACTCCTCCATTTCGGTTACTGAGAGAGATATGTCGTTGAAAATTCACCGAGTAGATTGTAAATATGATGTGGTTGCTGATAATACAACAGCAACGAAAGAGGAGGTGTCTGTACTGCGAGGTGATATGACATCGATTAGTTTAGAAATCGAGGATGTTACTCGTACAATTCAGATGATGGATTCTAGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770223.1
MMFATRGGLNDACSSVAKQLDNVYSSISVTERDMSLKIHRVDCKYDVVADNTTATKEEVSVLRGDMTSISLEIEDVTRTIQMMDSRINRMEVNQVLFTMTLHQIRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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