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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000436`

染色体: Chr06 坐标: 3573063-3586788 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000436`
名称	SmilChr06G000436
描述	SEC14 cytosolic factor-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3573063 - 3586788 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990057`
GeneID	`130990057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990057`
原始查询	`LOC130990057`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SEC14 cytosolic factor-like
产物	SEC14 cytosolic factor-like
Arabidopsis	`AT1G01630` (AT1G01630) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839231] identity=58.4; qcov=0.873; evalue=2.21e-102; confidence=high
Rice	`Os03g0850700` - identity=49.4; qcov=0.918; evalue=1.54e-82; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF13716 (CRAL_TRIO_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770237.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770237.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770237.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770237.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3573173`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A8,A9,B105,B11,B113,B117,B127,B129,B130,B132,B14,B18,B21,B34,B41,B47,B59,B64,B66,B73,B89,B9,B93,B94,C29,C3,C46,C70,C74
`Chr6:3573269`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A8,A9,B105,B11,B113,B117,B127,B129,B130,B132,B14,B18,B21,B34,B41,B47,B59,B64,B66,B73,B89,B9,B93,B94,C29,C3,C46,C70,C74
`Chr6:3573370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:3585279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B35,B53
`Chr6:3585293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr6:3585624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:3585663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:3585792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:3586567`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A16,A21,B110,B28,B3,B37,B62,C12,C83,C84
`Chr6:3586574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B53
`Chr6:3586698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770237.1

267 aa

134

267

CRAL_TRIO

CRAL_TRIO_2

PF00650 CRAL_TRIO 110-257 aa PF13716 CRAL_TRIO_2 122-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770237.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	110	257	1.2e-35	123.3	CRAL/TRIO domain
`XP_057770237.1`	Pfam	`PF13716`	CRAL_TRIO_2	Domain	122	254	1.7e-12	48.6	Divergent CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914254.1
AAAATCTCCTACATTTCGTCACAATCTTGCTTCAGAATCAAATCCCAGATGGAGAGAACTTTGAAGCAAAAAGAAGAAGACGACGTAGAAGAAGAAATATTCTACTCTCCTAATTGTATTGATGAAGAAAATGAAGAGATTCAAAGCAATGATGATGAGGAAAAGAAGAAGATTCATCATTTGAGAGAGATAGTTGCAAAGCAAGATCCTGCAGCTTGCGAGGAAGTAGATGAGGGCACATTGAGAAGATTTCTTCGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990057
ATGGAGAGAACTTTGAAGCAAAAAGAAGAAGACGACGTAGAAGAAGAAATATTCTACTCTCCTAATTGTATTGATGAAGAAAATGAAGAGATTCAAAGCAATGATGATGAGGAAAAGAAGAAGATTCATCATTTGAGAGAGATAGTTGCAAAGCAAGATCCTGCAGCTTGCGAGGAAGTAGATGAGGGCACATTGAGAAGATTTCTTCGTGATCGTGATCTCGACATCGAGAAGGCTTCGACGATGCTGATGAAGTACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770237.1
MERTLKQKEEDDVEEEIFYSPNCIDEENEEIQSNDDEEKKKIHHLREIVAKQDPAACEEVDEGTLRRFLRDRDLDIEKASTMLMKYLTWRRSFVPTGSISASEAPNHVAHKKVFVQGTDKRGCPVAVVFGAKHFPSKGNNEEFKRFAVFVLDKICSRIPNGEEKFTSIVDLEGFGYSNSDVRGYIAVLSILQNYYPERLQKVFLIHASYVFMAAWKVVYPFVDKNTRKKITFVENKKIQSALLEEIDVDQLPYIYGGKLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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