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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000511`

染色体: Chr06 坐标: 4242215-4242634 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000511`
名称	SmilChr06G000511
描述	ribosomal RNA-processing protein 15-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4242215 - 4242634 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990066`
GeneID	`130990066`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990066`
原始查询	`LOC130990066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosomal RNA-processing protein 15-like
产物	ribosomal RNA-processing protein 15-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0622600` - identity=34.1; qcov=0.633; evalue=1.2e-06; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02892 (zf-BED)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990066

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770248.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770248.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770248.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770248.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770248.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4242260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:4242277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:4242293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B36,B9,C69
`Chr6:4242309`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B19,B60
`Chr6:4242309`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B19,B60
`Chr6:4242331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B16,B25,C48
`Chr6:4242337`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,B95
`Chr6:4242337`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B41,B95
`Chr6:4242360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C16
`Chr6:4242430`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A2,A21,A4,B100,B102,B114,B125,B126,B14,B27,B30,B31,B40,B42,B43,B5,B51,B55,B66,B84,B85,B88,B91,C13,C14,C2,C36,C4,C62,C65,C77,D10,D3
`Chr6:4242484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B43,C80,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770248.1

139 aa

139

zf-BED

PF02892 zf-BED 91-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770248.1`	Pfam	`PF02892`	zf-BED	Domain	91	121	0.00013	22.7	BED zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914265.1
ATGGCAAATTTAATAGAAAATGCACCTCCAGAAAATGAGACAATGGAGAAAGAGAATGAGGTGGAGAAAGAAGTGGTCGATGTAAATGATGATAAAGATGATAATATAATAGAAGGGGATGATGGGGAGAAAGATAAACAAGAAGGTATTGATGGAGAAGATGATAAAGATGGAGACAAGGAGGAGGAGAATAATGTGTTTGATAAGAAGAAAAGGAAAAAATGTTCCAAAGCTTATGATGATTTCATTGAAGTGACAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990066
ATGGCAAATTTAATAGAAAATGCACCTCCAGAAAATGAGACAATGGAGAAAGAGAATGAGGTGGAGAAAGAAGTGGTCGATGTAAATGATGATAAAGATGATAATATAATAGAAGGGGATGATGGGGAGAAAGATAAACAAGAAGGTATTGATGGAGAAGATGATAAAGATGGAGACAAGGAGGAGGAGAATAATGTGTTTGATAAGAAGAAAAGGAAAAAATGTTCCAAAGCTTATGATGATTTCATTGAAGTGACAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770248.1
MANLIENAPPENETMEKENEVEKEVVDVNDDKDDNIIEGDDGEKDKQEGIDGEDDKDGDKEEENNVFDKKKRKKCSKAYDDFIEVTADDGTTKFQCIHCKTFLAKTSTGTTSHLWNHLKRCLQKKLHLKKQKTLQFLWD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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