当前解析结果
SmilChr06G000526| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000526 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000526 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000526 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 4334060 - 4335228 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990069 |
|---|---|
| GeneID | 130990069 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990069 |
| 原始查询 | LOC130990069 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990069 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770252.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057770252.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770252.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770252.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770252.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:4334129 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,C23 |
Chr6:4334152 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B11 |
Chr6:4334168 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | C48,C61 |
Chr6:4334168 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | C48,C61 |
Chr6:4334189 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B140,C46,C72,D10 |
Chr6:4334282 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr6:4334346 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr6:4334378 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr6:4334440 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,C61 |
Chr6:4334441 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,C61 |
Chr6:4334456 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 15 | A10,B126,B16,B18,B83,B95,C26,C35,C40,C41,C47,C59,C64,C66,C81 |
Chr6:4334501 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,B33,C31 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。