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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000533`

染色体: Chr06 坐标: 4400996-4403139 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000533`
名称	SmilChr06G000533
描述	uncharacterized SmilChr06G000533
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4400996 - 4403139 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990071`
GeneID	`130990071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990071`
原始查询	`LOC130990071`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=low
产物	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G07190` (AT2G07190) transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288] identity=29.5; qcov=0.36; evalue=3.59e-11; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770254.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770254.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770254.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770254.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770254.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4401073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A25,B105,B107,B112,B27,B38,B39,B5,B54,B60,B98,C12,C23,C26,C33,C36,C4,C53,D3,D5
`Chr6:4401146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B76,B94
`Chr6:4401193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C23
`Chr6:4401193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:4401249`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	98	A1,A11,A15,A16,A2,A24,A25,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B104,B105,B109,B110,B114,B117,B121,B122,B126,B128,B139,B16,B17,B18,B20,B29,B3,B30,B32,B33,B35,B40,B42,B43,B5,B52,B53,B54,B55,B60,B62,B66,B68,B69,B72,B75,B76,B84,B9,B91,B93,B96,B97,B98,C10,C11,C12,C16,C19,C20,C23,C24,C26,C27,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C4,C40,C41,C43,C46,C48,C49,C50,C53,C57,C58,C64,C66,C67,C68,C72,C75,C80,C82,C83,C9,D2,D3,D7,D9
`Chr6:4401261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,D11
`Chr6:4401277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B22,B41
`Chr6:4401297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:4401326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr6:4401352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:4401753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B135,B136,B89
`Chr6:4401771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C24,C49,C83,C85,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770254.1

339 aa

170

339

DUF1985

DUF8566

PF09331 DUF1985 9-143 aa PF29561 DUF8566 23-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770254.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	9	143	2.1e-17	64.1	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057770254.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	23	164	5e-12	46.7	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914271.1
ATTGTATATGATTTCCGCAAGTGGGTGTTGTGAATTTTTAAACAATTAAAAATTGTGAATTTTTTACTAATGGGTTGAAGATTGTGATTTTTTTACGTATTGTTTGTGATTTTTTTTCTTCTTTTAAGTCAATACCTTTTTAGCCATTCCCAAATCCTTGCCATTTTGCGTATTGTTTGGCTAAATTGTGGGATTTTATTATAACAAATTTGGCGAAGATTGTTTGCGCATAAATGTTAAATAATTGATTTGTTTTTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990071
ATGGTCGTTCATCAAGTAGTCTCTCGCCAAATAAAGTCAAGCCGTGATGGTCTTTTCTTTTTATTGAATAATACGAGAGTTCATTTTTCGAAGAGGGATTATGCTTTAGTGACTGGTCTTAATTTTGGTGATTTTAATGTAGATATGTCGCGTAATCATGATTTGAGTGGAGTGGAAGTGTTTAATAAATTTAATTGTGATGAGTCTCATGTGAAACTATCAACCCTCATTGATCTTTTTGAGAATTTTGAAATTGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770254.1
MVVHQVVSRQIKSSRDGLFFLLNNTRVHFSKRDYALVTGLNFGDFNVDMSRNHDLSGVEVFNKFNCDESHVKLSTLIDLFENFEIDDEDGSLYLRIAYIIVLYGMLVGYETDKTIEHWVWALVDDLDAFNQFPWGAYTYNLLCYYTTNCKSKKQYKLYGPVWALHVWSLEIVPDLGNVVGNCVAEFAHPRCLKWMFRSRPATKDLRPFFEKEEQEILELVADEFEVSTMYYLSTIGVYMGAQHDEARVYMGAQHDEAPNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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