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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000549`

染色体: Chr06 坐标: 4611236-4625731 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000549`
名称	SmilChr06G000549
描述	ribosome biogenesis protein BOP1 homolog
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4611236 - 4625731 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990073`
GeneID	`130990073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990073`
原始查询	`LOC130990073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosome biogenesis protein BOP1 homolog
产物	ribosome biogenesis protein BOP1 homolog
Arabidopsis	`AT2G40360` (AT2G40360) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818629] identity=64.3; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0435400` (OsWD40-143) - identity=63; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000463 (maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005515 (protein binding); GO:0030687 (preribosome, large subunit precursor); GO:0042254 (ribosome biogenesis); GO:0043021 (ribonucleoprotein complex binding); GO:0070545 (PeBoW complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF08145 (BOP1NT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770256.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057770256.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057770256.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770256.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4611654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C48,C61,C64,C66
`Chr6:4611673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B80,B9
`Chr6:4611708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84
`Chr6:4611737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:4620934`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B78
`Chr6:4620934`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B78
`Chr6:4621080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B83,C11
`Chr6:4621104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B83,C11,C47
`Chr6:4621276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:4621809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr6:4622076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:4622084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770256.1

694 aa

347

694

BOP1NT

WD40

PF08145 BOP1NT 90-352 aa PF00400 WD40 354-390 aa PF00400 WD40 601-637 aa PF00400 WD40 653-692 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770256.1`	Pfam	`PF08145`	BOP1NT	Domain	90	352	2.3e-101	339.8	BOP1NT (NUC169) domain
`XP_057770256.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	354	390	2.6e-29	101.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057770256.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	601	637	2.6e-29	101.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057770256.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	653	692	2.6e-29	101.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914273.1
ATGACGCTTCTTAAGTGTCATCTTATTGAGAGGGATGCTGTTCAATCCAGTGATGATGATGATAATTCAGTTAGTGCTTGCCATGATAAAGACTCTGTCGAAGATAACAACCATAGCAGTGTTAGCAAAGGTGATGAACATGATAAGTTTGGTGTTGAAGACAGCGGTGGAAGGAGTGATGATTCTCGTGAAATTGTTGAGGAGAGTGACTCATCTGAAGATGAGGTTGCACCTCGCAATACTATTGGAAATGTTCCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990073
ATGACGCTTCTTAAGTGTCATCTTATTGAGAGGGATGCTGTTCAATCCAGTGATGATGATGATAATTCAGTTAGTGCTTGCCATGATAAAGACTCTGTCGAAGATAACAACCATAGCAGTGTTAGCAAAGGTGATGAACATGATAAGTTTGGTGTTGAAGACAGCGGTGGAAGGAGTGATGATTCTCGTGAAATTGTTGAGGAGAGTGACTCATCTGAAGATGAGGTTGCACCTCGCAATACTATTGGAAATGTTCCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770256.1
MTLLKCHLIERDAVQSSDDDDNSVSACHDKDSVEDNNHSSVSKGDEHDKFGVEDSGGRSDDSREIVEESDSSEDEVAPRNTIGNVPLKWYKDEEHIGYDLSGKKIKKKEKTSKLDSFLARTDDAKSWRKIIDEYNDEEVELTKEEINLIRRMMESKAPHADFDPYPSYIDWFTWDGAKHPLSNAPEPKRRFILSKWDAKKVVKYVRAIRNGQIKFDDKPKEEHKFYDLWGEASSADRQEASSADRQGLAYIPAPKPKLPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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