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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000007`

染色体: Chr06 坐标: 180367-184233 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000007`
名称	SmilChr06G000007
描述	dephospho-CoA kinase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	180367 - 184233 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990083`
GeneID	`130990083`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990083`
原始查询	`LOC130990083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dephospho-CoA kinase-like
产物	dephospho-CoA kinase-like
Arabidopsis	`AT2G27490` (ATCOAE) dephospho-CoA kinase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817294] identity=68.3; qcov=0.991; evalue=1.04e-115; confidence=high
Rice	`Os01g0360600` - identity=65.5; qcov=1; evalue=8.79e-111; confidence=high
GO	GO:0004140 (dephospho-CoA kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0015937 (coenzyme A biosynthetic process)
KEGG	smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01121 (CoaE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990083

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057770274.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057770271.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057770271.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057770271.1`
5	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057770274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:182114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,B89,C52,C55
`Chr6:182144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr6:182153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr6:182157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr6:182410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B7,C58
`Chr6:182411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:183439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B8,C39
`Chr6:183456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C54
`Chr6:183501`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A13,A16,B12,B134,B45,B74,B95,C17,C28,C69,D9
`Chr6:183777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B8,C39,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770271.1

262 aa

131

262

CoaE

PF01121 CoaE 36-215 aa

XP_057770272.1

262 aa

131

262

CoaE

PF01121 CoaE 36-215 aa

XP_057770273.1

262 aa

131

262

CoaE

PF01121 CoaE 36-215 aa

XP_057770274.1

229 aa

114

229

CoaE

PF01121 CoaE 3-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770271.1`	Pfam	`PF01121`	CoaE	Domain	36	215	1.5e-59	201.5	Dephospho-CoA kinase
`XP_057770272.1`	Pfam	`PF01121`	CoaE	Domain	36	215	1.5e-59	201.5	Dephospho-CoA kinase
`XP_057770273.1`	Pfam	`PF01121`	CoaE	Domain	36	215	1.5e-59	201.5	Dephospho-CoA kinase
`XP_057770274.1`	Pfam	`PF01121`	CoaE	Domain	3	182	1.1e-59	201.9	Dephospho-CoA kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914288.1
AAGATAATTTTAATTCTAATCAATCATAAACTGCAAATCAAACGGCCCATGAGTCAATGATCAAACCCTAAGTAACAGCAGCTGAGCTGCCTGCCGTGCCCCATCCTCTTCCCCCTCCCCCCAATCTCTCGACTCTCATCTCTCTCGGCTGATCGACGACCGGCGACCGGCGCAACGGCGAGTCGTCCTTCCGGCGAGCCTAACAGTAGCAAGGAGCCGCCGCCCTTGGGCCGTCCAAAAGGTGTCACGCCAAAATACAG...

XM_057914290.1
AAACGGCCCATGAGTCAATGATCAAACCCTAAGTAACAGCAGCTGAGCTGCCTGCCGTGCCCCATCCTCTTCCCCCTCCCCCCAATCTCTCGACTCTCATCTCTCTCGGCTGATCGACGACCGGCGACCGGCGCAACGGCGAGTCGTCCTTCCGGCGAGCCTAACAGTAGCAAGGAGCCGCCGCCCTTGGAAGTTACCAGTATAAGTAACCCTGGATGATAACCAAGACATTGAGCAAAAAATCTCTGAAGCGAATTCTT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130990083
ATGATAACCAAGACATTGAGCAAAAAATCTCTGAAGCGAATTCTTCAAAAATCTGGGGCAAATTTACCGGATTTCAATTTCCGGCGGCACTTCTTCCCAATGAGGATTGTCGGACTGACCGGCGGCATAGGATCGGGCAAGAGTACGGTTTCAAATCTCTTCAAAGCTCAGGGTATTCCCGTCGTCGATGCTGACGTTGTAGCTCGCAATGTTCTGAAGAAAGGAACTGGTGGGTGGAGGAAAGTGGTGGCTGCGTTCGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057770271.1
MITKTLSKKSLKRILQKSGANLPDFNFRRHFFPMRIVGLTGGIGSGKSTVSNLFKAQGIPVVDADVVARNVLKKGTGGWRKVVAAFGNEILLPSGEVDRPKLGQIVFNDLNKRQLLNRLLAPYISSRIFLEVFKLWMKGCKIIVLDVPLLFEAKMDKWTKPIIVVWVDPKTQLERLMSRDGTTAEDANSRINAQMPLDLKKTKADIVIDNSGSLDDLSERFRQSLVDVKKPLTWTEFGLCRDGALVAFVSILCGVIICRK...

XP_057770272.1
MITKTLSKKSLKRILQKSGANLPDFNFRRHFFPMRIVGLTGGIGSGKSTVSNLFKAQGIPVVDADVVARNVLKKGTGGWRKVVAAFGNEILLPSGEVDRPKLGQIVFNDLNKRQLLNRLLAPYISSRIFLEVFKLWMKGCKIIVLDVPLLFEAKMDKWTKPIIVVWVDPKTQLERLMSRDGTTAEDANSRINAQMPLDLKKTKADIVIDNSGSLDDLSERFRQSLVDVKKPLTWTEFGLCRDGALVAFVSILCGVIICRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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