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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002048`

染色体: Chr06 坐标: 26891616-26894811 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002048`
名称	SmilChr06G002048
描述	transcription factor SPATULA
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	26891616 - 26894811 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990106`
GeneID	`130990106`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990106`
原始查询	`LOC130990106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor SPATULA
产物	transcription factor SPATULA
Arabidopsis	`AT4G36930` (SPT) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829847] identity=67.4; qcov=0.384; evalue=5.48e-47; confidence=low
Rice	`Os02g0805250` (OsbHLH107) - identity=68.4; qcov=0.331; evalue=6.77e-41; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990106

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770293.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770293.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770293.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770293.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770293.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:26891922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B137,B55,C2
`Chr6:26891944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C43,D7
`Chr6:26892439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B140
`Chr6:26894287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770293.1

345 aa

172

345

HLH

PF00010 HLH 121-168 aa

XP_057770294.1

344 aa

172

344

HLH

PF00010 HLH 121-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770293.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	121	168	3.3e-14	53.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057770294.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	121	168	3.4e-14	53.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914310.1
GAAAAGGCAGAAGAAGAAAGAGAAAAGGAAGAAGAAGAGAAAAAAAACATTTCATTCTTCTCCCACAAAAACTAGTACACTGCACACTTTTGCGTGGCTTTTTGCAGTCTTTTTTGAGCTCTTAAATAAATGAAGCCAAACACACGCGCCTCCCTCCGCCTTACTCAAAAGCCGCGCTTTTCATCACAACTGCTCTCTCTCTCTTTCTCGCAAGTCGCAACGCAAGACACGACGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTTTC...

XM_057914311.1
CTCCCACAAAAACTAGTACACTGCACACTTTTGCGTGGCTTTTTGCAGTCTTTTTTGAGCTCTTAAATAAATGAAGCCAAACACACGCGCCTCCCTCCGCCTTACTCAAAAGCCGCGCTTTTCATCACAACTGCTCTCTCTCTCTTTCTCGCAAGTCGCAACGCAAGACACGACGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTTTCAAGCAAAAATATAGCAGAGGCTGTTTTTCATGATTTCAGCTAGCATTCAATGGCGAATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990106
ATGGCGAATCTCTACGATACTTCTACTAACAATTATTACTCTCCTCAAGAGCCAGACGAGATTTCTCTTTTCCTCCAGCAAATTCTGCTCCGTTCCAATTCTTCGCCGTCGCATTCATTGCCGCGGCAGCACTCTCATCTCGTACCGACCTCCGATGGCATCGCGGCGGAGCAGCACGTGGCAATTGGTCAGATCTCCGCGTTGAACTCGTGCTCCACTTGCGGCTTCGCGAATGTATCGCTCGAAAACTTGGAGAATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770293.1
MANLYDTSTNNYYSPQEPDEISLFLQQILLRSNSSPSHSLPRQHSHLVPTSDGIAAEQHVAIGQISALNSCSTCGFANVSLENLENETDDCDYESEEAVEAAVGETVAKARCSTKRTRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMRNGLNLYPICLPGMLQSNQVSQMRADVYATDKYSNVNMMKEVRLDQNISADSLLGLPENCVKQENVSDFSSMIGSKTSMEVESS...

XP_057770294.1
MANLYDTSTNNYYSPQEPDEISLFLQQILLRSNSSPSHSLPRQHSHLVPTSDGIAAEQHVAIGQISALNSCSTCGFANVSLENLENETDDCDYESEEAVEAAVGETVAKARCSTKRTRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLTMRNGLNLYPICLPGMLQSNQVSQMRADVYATDKYSNVNMMKEVRLDQNISADSLLGLPENCVKQENVSDFSSMIGSKTSMEVESS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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