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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001428`

染色体: Chr06 坐标: 15119624-15120404 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001428`
名称	SmilChr06G001428
描述	probable WRKY transcription factor 69
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15119624 - 15120404 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990118`
GeneID	`130990118`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990118`
原始查询	`LOC130990118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 69
产物	probable WRKY transcription factor 69
Arabidopsis	`AT4G01250` (WRKY22) WRKY family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827896] identity=71.4; qcov=0.208; evalue=8.71e-10; confidence=weak
Rice	`Os02g0265200` (OsWRKY39) - identity=91.3; qcov=0.137; evalue=2.33e-08; confidence=weak
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990118

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770302.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770302.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770302.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770302.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770302.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15119672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:15119686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:15119689`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A13,A14,A21,B111,B113,B56,B64,B69,B83,B92,C1,C77,C9
`Chr6:15119717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B137,B31,B79,B88,C15,C17,C52
`Chr6:15119736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B111,B56
`Chr6:15119757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:15119771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:15119798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,D3
`Chr6:15119803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B40,C5,C8
`Chr6:15119810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr6:15119825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr6:15119837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C23,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770302.1

168 aa

168

WRKY

PF03106 WRKY 9-29 aa

XP_057770303.1

168 aa

168

WRKY

PF03106 WRKY 9-29 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770302.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	9	29	1.7e-06	28.9	WRKY DNA -binding domain
`XP_057770303.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	9	29	1.7e-06	28.9	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914320.1
CTCAGATTAAATATGCATATTCAAGAAAATGTACAGTTTAACATAGGTTTCTCCCCCCCCCCCTCAGAATTTCCCAGCCACCGTAATTCCTCAGCCTGTTCGACCACGACGAAGGAAAAATCAGCAGATGAAAATGGTGCGTTAAATGGCGCAAGAAGAGCTCTCTGCTGATTCATGGGCATGGCGGAAATATGGTCAGAAGCCCATTAAAGGTTCTCCGTATCCGAGGTGCAGCACCCGCAACAAACTCGCTTCTCTGC...

XM_057914319.1
AAATATGCATATTCAAGAAAATGTACAGTTTAACATAGGTTTCTCCCCCCCCCCCTCAGAATTTCCCAGCCACCGTAATTCCTCAGCCTGTTCGACCACGACGAAGGTAGGGTCGTTTACATAGGAAAAATCAGCAGATGAAAATGGTGCGTTAAATGGCGCAAGAAGAGCTCTCTGCTGATTCATGGGCATGGCGGAAATATGGTCAGAAGCCCATTAAAGGTTCTCCGTATCCGAGGTGCAGCACCCGCAACAAACTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990118
ATGGCGCAAGAAGAGCTCTCTGCTGATTCATGGGCATGGCGGAAATATGGTCAGAAGCCCATTAAAGGTTCTCCGTATCCGAGGTGCAGCACCCGCAACAAACTCGCTTCTCTGCCGCCCAAAGGGCTCGATGTCGAATATGGCTTCTTCTTCGTCGTCGTCGCCCGCCGCCGGAGCGAGTTTTTCTCCGGATACTCTGTCGATGGAAGGCGAACACAGAACGAGGACGTGCAGATGGCCGAGGAGGACGACGGCGCCGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770302.1
MAQEELSADSWAWRKYGQKPIKGSPYPRCSTRNKLASLPPKGLDVEYGFFFVVVARRRSEFFSGYSVDGRRTQNEDVQMAEEDDGAVDEDDENIIMIPSDLMIDDDDMFGSGFQDSKDHSSGGGGDFFLMSPRRGHRPAPPAHSTAVTKGTWKSLMDHCFLEMDGKTG

XP_057770303.1
MAQEELSADSWAWRKYGQKPIKGSPYPRCSTRNKLASLPPKGLDVEYGFFFVVVARRRSEFFSGYSVDGRRTQNEDVQMAEEDDGAVDEDDENIIMIPSDLMIDDDDMFGSGFQDSKDHSSGGGGDFFLMSPRRGHRPAPPAHSTAVTKGTWKSLMDHCFLEMDGKTG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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