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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001430`

染色体: Chr06 坐标: 15128916-15130780 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001430`
名称	SmilChr06G001430
描述	uncharacterized SmilChr06G001430
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15128916 - 15130780 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990119`
GeneID	`130990119`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990119`
原始查询	`LOC130990119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820232]; symbol=AT3G10630; hit=AT3G10630; species=arabidopsis; confidence=high
产物	UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820232]; symbol=AT3G10630; hit=AT3G10630; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G10630` (AT3G10630) UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820232] identity=61.7; qcov=0.931; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0296700` - identity=58.7; qcov=0.909; evalue=4.99e-164; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00534 (Glycos_transf_1); PF13692 (Glyco_trans_1_4); PF20706 (GT4-conflict)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990119

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057770304.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770304.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770304.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770304.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770304.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15129148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B59,B9,C38,D2
`Chr6:15129568`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr6:15129568`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr6:15129938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr6:15130244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:15130406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770304.1

463 aa

232

463

Glyco_trans_1_4

Glycos_transf_1

GT4-conflict

PF13692 Glyco_trans_1_4 254-385 aa PF00534 Glycos_transf_1 327-383 aa PF20706 GT4-conflict 334-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770304.1`	Pfam	`PF13692`	Glyco_trans_1_4	Domain	254	385	2.8e-16	60.8	Glycosyl transferases group 1
`XP_057770304.1`	Pfam	`PF00534`	Glycos_transf_1	Domain	327	383	4.4e-15	56.4	Glycosyl transferases group 1
`XP_057770304.1`	Pfam	`PF20706`	GT4-conflict	Family	334	450	8.9e-07	28.9	Family 4 Glycosyltransferase in conflict systems

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914321.1
ATTAATTCATTTTGACCGTGACTAATTATACGCGTTACATAGTTGAATTTTCATAATTAACAATTTACAGCTAAAGTCATTATAGGATGATCCCGTGATTTTTGTTTCTTTTGTTTTACGAAGCGAAATACAATTATTATTATTAGATTATGTTTTTATTAATAAAAAGAAATAAAAAAACCCTTGAAAACCTGGATGCCATGGCTCTTCTCTTGTAAAACATAACTGTATTCAGATGAAAATCCTAGAATGAGAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990119
ATGAGAAATCTACCCATTTCTCTAATTTCCATCTTCATGCTCTTCCTCGCCATTTCCCTCACCATAATAACCCCAAAATCGACCTTTCTTCTCCACCCCAAATTTCTCCAAATAATCTTCAAATTCCAGCATATCCTCCCAACCATTAGGAAAAACCCAATTCACGAACCCCCTTATTGCCTCCTATGGATGGCCCCTTTCCTCTCCGGCGGCGGCTACAGCTCCGAAGCCTGGTCCTACATTCTCGCACTCAACGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770304.1
MRNLPISLISIFMLFLAISLTIITPKSTFLLHPKFLQIIFKFQHILPTIRKNPIHEPPYCLLWMAPFLSGGGYSSEAWSYILALNAYLKKQKAPIFKLRIEHYADLQDMEFWVGLPPEMRNLAINLYQTKCKPNQTLVICHSEPGAWHPPLYETLPCPPSGYGQFKAVVGRTMFETDRVNEEHVGRCNRMDYVWVPTDFHVATFRQSGVDPLKLRKIIQPVDSTFFDPLKVEPLRLDAVSRAVLGSEKLISRAKFVFLSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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