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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001465`

染色体: Chr06 坐标: 15504690-15511861 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001465`
名称	SmilChr06G001465
描述	protein SEMI-ROLLED LEAF 2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15504690 - 15511861 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990150`
GeneID	`130990150`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990150`
原始查询	`LOC130990150`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SEMI-ROLLED LEAF 2
产物	protein SEMI-ROLLED LEAF 2
Arabidopsis	`AT2G41830` (AT2G41830) Uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818782] identity=53.1; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0780500` (OsSTA80) - identity=48.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21052 (EFR3_ARM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990150

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770344.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770344.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770344.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770344.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770344.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15505255`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B1,B22,B77,C12
`Chr6:15505255`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B1,B22,B77,C12
`Chr6:15505261`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B1,B22,B77,C12,D2
`Chr6:15505261`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B1,B22,B77,C12,D2
`Chr6:15505263`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B1,B22,B77,C12,D2
`Chr6:15505263`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B1,B22,B77,C12,D2
`Chr6:15506401`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	39	A22,B10,B101,B106,B108,B119,B12,B120,B128,B129,B134,B15,B16,B3,B31,B57,B67,B71,B78,B85,B9,C11,C3,C38,C4,C45,C52,C53,C56,C58,C59,C60,C77,C8,C80,C87,D3,D4,D9
`Chr6:15506407`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A22,B10,B101,B106,B108,B119,B120,B129,B134,B135,B15,B16,B3,B31,B71,B78,B85,B9,C11,C3,C38,C4,C45,C53,C56,C58,C59,C60,C77,C8,C80,C87,D3,D4,D9
`Chr6:15506427`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A22,B10,B106,B108,B120,B129,B134,B15,B31,B57,B62,B66,B67,B71,B78,B9,C11,C3,C4,C45,C53,C56,C58,C60,C77,C8,C80,C87,D3,D4,D9
`Chr6:15507659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D10
`Chr6:15507667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr6:15508247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C18,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770344.1

986 aa

493

986

EFR3_ARM

PF21052 EFR3_ARM 59-742 aa

XP_057770345.1

986 aa

493

986

EFR3_ARM

PF21052 EFR3_ARM 59-742 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770344.1`	Pfam	`PF21052`	EFR3_ARM	Repeat	59	742	1.7e-83	282.1	EFR3, armadillo repeat
`XP_057770345.1`	Pfam	`PF21052`	EFR3_ARM	Repeat	59	742	1.7e-83	282.1	EFR3, armadillo repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914362.1
AGAGAGAATCACAAAAGGTTGGCTGGCTGTAGAAAGGTGGAGGGGAGAGAGAGAGACATAATTTACGGGAAAATGCTTGAAATTCGGTACATTGTTGGCAATCTTTGATGGGTTACCAGCCTTCTGGTCTGCTCTTTACAGGAATTGATCCGAAGGAATTGCCTGCTCGATTTTGATACCTCCAGCTTTCCTTTCCCTTCTATATTTTTTGAGGTAGAGAAGGGAAAGAGAGCACAAATTTGAAGGTGATTTTTGGGGGA...

XM_057914361.1
CTGTAGAAAGGTGGAGGGGAGAGAGAGAGACATAATTTACGGGAAAATGCTTGAAATTCGGTACATTGTTGGCAATCTTTGATGGGTTACCAGCCTTCTGGTCTGCTCTTTACAGGAATTGATCCGAAGGTAAAGTCAGGAAAACTCCCTTTTATTCATATCAACATAGATAGGAATAAAGGGATGTTGAAAAATTTCCCCAACATTTTATGCTATTTTGGATTATAATTATCTGTTATTCAATCAACAATCGTTGAATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990150
ATGAGTGTTGTTTCCGGGGTTATCTCAAGGCAAGTCTTGCCAGCATGTGATAACCTCTGCTTCTTCTGCCCTGCATTGCGTACGAGGTCGAGGCAGCCGGTGAAGAGGTACAAGCACTTGATATCAGATATTTTCCCCCGGTCTCAGGATGAAGAAGTGAATGAGAGGAAGATTGGGAAATTATGTGACTACGCTTCAAAAAATCCTTTACGCATTCCCAAGATAGCGGACTCCCTCGAACAGAGATTCTACAAGGAATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770344.1
MSVVSGVISRQVLPACDNLCFFCPALRTRSRQPVKRYKHLISDIFPRSQDEEVNERKIGKLCDYASKNPLRIPKIADSLEQRFYKELRNENYRFVKIVMLIYRKFLLSCKDQMPLFANSLLSIMFALLDQTSQDGVLIIGCESLFDFVNNQKDGTYMFNLEGLIPKLCQVAQEVGDDERTEHLRAAGLQALSAMVWFMGENSHISVEFDNIVSVVLENYKGQSKESGGSDQNGWVQEVNKAEGYVSPSLDAATKVPSWRI...

XP_057770345.1
MSVVSGVISRQVLPACDNLCFFCPALRTRSRQPVKRYKHLISDIFPRSQDEEVNERKIGKLCDYASKNPLRIPKIADSLEQRFYKELRNENYRFVKIVMLIYRKFLLSCKDQMPLFANSLLSIMFALLDQTSQDGVLIIGCESLFDFVNNQKDGTYMFNLEGLIPKLCQVAQEVGDDERTEHLRAAGLQALSAMVWFMGENSHISVEFDNIVSVVLENYKGQSKESGGSDQNGWVQEVNKAEGYVSPSLDAATKVPSWRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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