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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001466`

染色体: Chr06 坐标: 15522169-15525606 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001466`
名称	SmilChr06G001466
描述	uncharacterized SmilChr06G001466
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15522169 - 15525606 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990152`
GeneID	`130990152`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990152`
原始查询	`LOC130990152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0114500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0114500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G01170` (AT1G01170) ozone-responsive stress-like protein (DUF1138) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839263] identity=79.2; qcov=0.9; evalue=1.11e-38; confidence=medium
Rice	`Os06g0114500` - identity=78.7; qcov=0.938; evalue=2.79e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06592 (DUF1138)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990152

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770348.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057770348.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057770348.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770348.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15525068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C26
`Chr6:15525074`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A1,A19,B10,B111,B114,B115,B127,B13,B132,B139,B18,B19,B21,B34,B35,B49,B53,B58,B67,B7,B70,B71,B74,B76,B91,B93,C11,C17,C2,C20,C25,C29,C46,C48,C49,C51,C57,C60,C67,C68,C70,C72,C76,C81,D10,D4
`Chr6:15525105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr6:15525262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C26
`Chr6:15525296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C86
`Chr6:15525322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B90,B92
`Chr6:15525345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B55,C31,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770348.1

80 aa

DUF1138

PF06592 DUF1138 4-75 aa

XP_057770349.1

80 aa

DUF1138

PF06592 DUF1138 4-75 aa

XP_057770350.1

80 aa

DUF1138

PF06592 DUF1138 4-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770348.1`	Pfam	`PF06592`	DUF1138	Family	4	75	1.2e-42	144.6	Protein of unknown function (DUF1138)
`XP_057770349.1`	Pfam	`PF06592`	DUF1138	Family	4	75	1.2e-42	144.6	Protein of unknown function (DUF1138)
`XP_057770350.1`	Pfam	`PF06592`	DUF1138	Family	4	75	1.2e-42	144.6	Protein of unknown function (DUF1138)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914367.1
ATGTGAGTGGACTCAGTAATCCCGCCGCTTATTGATTCACGCACGATTCACTCGTAGTCCAATTCCACTTCTTCCATTTCCCATTCTATTTCTCCGCTCCCCTTTCATTTATGCTTTCGATATCTACTCGACTCCAGCGTCGTCAGTAGCTTGCCGCCGCTATCTCCCTCTCATCTCGTCTCATGCCTCCTCCTAATACTTTGGGAGTGAAAAATGTCGGGCAAATACATCTTTTCTGCTTTTGTGGGATCCCTTGCTAT...

XM_057914366.1
TGTGAGTGGACTCAGTAATCCCGCCGCTTATTGATTCACGCACGATTCACTCGTAGTCCAATTCCACTTCTTCCATTTCCCATTCTATTTCTCCGCTCCCCTTTCATTTATGCTTTCGATATCTACTCGACTCCAGCGTCGTCAGTAGCTTGCCGCCGCTATCTCCCTCTCATCTCGTCTCATGCCTCCTCCTAATAGTATGTGGATTTCGATTTTATCGCTTTGGGAGTGAAAAATGTCGGGCAAATACATCTTTTCTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130990152
ATGTCGGGCAAATACATCTTTTCTGCTTTTGTGGGATCCCTTGCTATTGCATATGCATGTGACTATTTGATTTCTGACCAGAAGATTTTTGGAGGTACCACTCCGTCAACTGTTTCGAACAAAGAATGGTGGCTGGCTACTGACAAAAAGTTTCAAGCATGGCCGCGAACTGCTGGTCCCCCAGTGGTGATGAATCCCATCAGCCGCCAGAACTTCATCGTGAAAGCCAGCCTCGACGAGTAA

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057770348.1
MSGKYIFSAFVGSLAIAYACDYLISDQKIFGGTTPSTVSNKEWWLATDKKFQAWPRTAGPPVVMNPISRQNFIVKASLDE

XP_057770349.1
MSGKYIFSAFVGSLAIAYACDYLISDQKIFGGTTPSTVSNKEWWLATDKKFQAWPRTAGPPVVMNPISRQNFIVKASLDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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