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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001475`

染色体: Chr06 坐标: 15654854-15656528 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001475`
名称	SmilChr06G001475
描述	uncharacterized SmilChr06G001475
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15654854 - 15656528 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990160`
GeneID	`130990160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990160`
原始查询	`LOC130990160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0328500` - identity=27.2; qcov=0.902; evalue=5.05e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770359.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770359.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770359.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770359.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15654946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:15654948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C57,C66,C76
`Chr6:15655334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B59,C85,D2
`Chr6:15655356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B52
`Chr6:15655378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B98,C18,C44
`Chr6:15655405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr6:15655422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:15655502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B107,C53,C87
`Chr6:15655529`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A20,A5,A8,B10,B104,B106,B110,B115,B120,B122,B132,B135,B137,B138,B16,B18,B19,B20,B25,B33,B34,B35,B42,B50,B52,B60,B63,B69,B73,B79,B81,B83,B86,B9,B99,C10,C26,C28,C35,C36,C41,C42,C50,C58,C6,C72,C75,C81,C84,C87,D11
`Chr6:15655535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B2,B24,B26,C8
`Chr6:15655546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:15655574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770359.1

163 aa

163

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 29-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770359.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	29	125	2.3e-06	29.2	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914376.1
CGGGAGTTGGAGAACGAATTCTCCATACCAAATTAATTTTCGAAGCATACTACCTTTTCGGTGGAGAAGAAACGCAGTTGGAGTCATGGCTTCGGCTCAACAAGGTTTGGTTGCAGGTAGCAACGAGATTGCTAAGGGCAAAGGCTGTAAGACAGACAAAACTCGGAGAAGCTGGTCGACAAAGGAAGAAGAGATACTGTTGGCTTCACTAAAGGAGCTCGTCGTTCTTGGCTGGAAAGCAGATAATGGGTTCAAGGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990160
ATGGCTTCGGCTCAACAAGGTTTGGTTGCAGGTAGCAACGAGATTGCTAAGGGCAAAGGCTGTAAGACAGACAAAACTCGGAGAAGCTGGTCGACAAAGGAAGAAGAGATACTGTTGGCTTCACTAAAGGAGCTCGTCGTTCTTGGCTGGAAAGCAGATAATGGGTTCAAGGCAGGCTACTTACACAAGCTGGAGGAGGCGATGAGGAAGGAGTTTCCTGATACGGATATTAAAGGGATGCCCCACATCAATTCGAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770359.1
MASAQQGLVAGSNEIAKGKGCKTDKTRRSWSTKEEEILLASLKELVVLGWKADNGFKAGYLHKLEEAMRKEFPDTDIKGMPHINSKLGAWKRNYNSLCLILDKTGVGFNSKGTFMIDCNNEQWEQIVVVDKNAGTMCFKSWPMFEGWQEVFGKDRAMAKLQNT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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