当前解析结果
SmilChr06G001482| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001482 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001482 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001482 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 15795913 - 15800034 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990167 |
|---|---|
| GeneID | 130990167 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990167 |
| 原始查询 | LOC130990167 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os05g0499500; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os05g0499500; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT2G32340 (AT2G32340)TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817795] identity=72.2; qcov=0.252; evalue=6.42e-10; confidence=weak |
| Rice | Os05g0499500- identity=64.3; qcov=0.294; evalue=4.52e-12; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990167 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057770366.1 |
| 2 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 0.20000 | XP_057770366.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057770366.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770366.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770366.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:15796718 |
G |
GCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 15 | A13,B102,B105,B11,B129,B134,B20,B61,B68,B70,B91,C37,C74,C78,D2 |
Chr6:15796724 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,C55 |
Chr6:15796749 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,B75,C9 |
Chr6:15797817 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,C39 |
Chr6:15798948 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,A7,B58 |
Chr6:15798958 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B121,B77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。