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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001503`

染色体: Chr06 坐标: 16073923-16075465 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001503`
名称	SmilChr06G001503
描述	AAA-ATPase ASD, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16073923 - 16075465 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990183`
GeneID	`130990183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990183`
原始查询	`LOC130990183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AAA-ATPase ASD, mitochondrial-like
产物	AAA-ATPase ASD%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G40010` (AATP1) AAA-ATPase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833998] identity=57.7; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0639200` - identity=50.5; qcov=1; evalue=1.08e-169; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF14363 (AAA_assoc); PF25568 (AAA_lid_At3g28540)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057770390.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057770390.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057770390.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057770390.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770390.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16074026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C85,C87
`Chr6:16074103`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B112,B31,B48,B69,C85,C87
`Chr6:16074188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr6:16074196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B31
`Chr6:16074234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C48
`Chr6:16074280`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C46
`Chr6:16074280`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C46
`Chr6:16074384`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	A15,A18,A23,A5,B102,B112,B118,B122,B126,B129,B130,B17,B31,B36,B4,B48,B53,B65,B68,B69,B7,B78,B94,B95,C17,C22,C31,C32,C41,C46,C5,C57,C68,C77,C85,C87,C9,D9
`Chr6:16074422`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B126
`Chr6:16074422`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B126
`Chr6:16074468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:16074565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770390.1

458 aa

229

458

AAA_assoc

AAA

AAA_lid_At3g28540

PF14363 AAA_assoc 28-122 aa PF00004 AAA 237-387 aa PF25568 AAA_lid_At3g28540 389-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770390.1`	Pfam	`PF14363`	AAA_assoc	Family	28	122	3.3e-25	89.0	Domain associated at C-terminal with AAA
`XP_057770390.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	237	387	3.1e-18	67.2	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057770390.1`	Pfam	`PF25568`	AAA_lid_At3g28540	Domain	389	456	6.8e-26	90.7	At3g28540-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914407.1
ATGAGGTTTGGAGAAGTATTTGCTCAATTAGGATCGGTGATTGCTGGTTTGATGTTCTTGAAAGCAATCTTAGAACAATACCTACCTCGTGAGCTCAAAAGCTCCTTCGACAAACACTCTCAGAGACTCTTCAATTTCTTCTCCCCTTACATCCAAATCAGCTTCAACGAGTTCACCGGCGAGCGCTTCAGGCGGAGCGACGTCTACGCCGCCATCGAGACCTACCTCAGCTCCACCTCCGCCACCCAGGCGCGGCGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990183
ATGAGGTTTGGAGAAGTATTTGCTCAATTAGGATCGGTGATTGCTGGTTTGATGTTCTTGAAAGCAATCTTAGAACAATACCTACCTCGTGAGCTCAAAAGCTCCTTCGACAAACACTCTCAGAGACTCTTCAATTTCTTCTCCCCTTACATCCAAATCAGCTTCAACGAGTTCACCGGCGAGCGCTTCAGGCGGAGCGACGTCTACGCCGCCATCGAGACCTACCTCAGCTCCACCTCCGCCACCCAGGCGCGGCGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770390.1
MRFGEVFAQLGSVIAGLMFLKAILEQYLPRELKSSFDKHSQRLFNFFSPYIQISFNEFTGERFRRSDVYAAIETYLSSTSATQARRLKADAVRDSTQAVSLSLDDNEEVADEHAGVKVWWASGKHVAKNQTFSFQPASDERRFYNLRFHKKHRSFIIETYLNHVMKEGKAIEVRNRRRKLYTNSGAAWSHVEFEHPATFETLAMEPERKREVVEDLLSFSRGEGFYKRIGRAWKRGYLLHGPPGTGKSTMIAAMANLLNY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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