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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001514`

染色体: Chr06 坐标: 16191720-16195675 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001514`
名称	SmilChr06G001514
描述	uncharacterized SmilChr06G001514
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16191720 - 16195675 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990196`
GeneID	`130990196`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990196`
原始查询	`LOC130990196`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histidine-tRNA ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820187]; symbol=AT3G10250; hit=AT3G10250; species=arabidopsis; confidence=high
产物	histidine-tRNA ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820187]; symbol=AT3G10250; hit=AT3G10250; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G10250` (AT3G10250) histidine-tRNA ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820187] identity=56.3; qcov=1.01; evalue=6.25e-121; confidence=high
Rice	`Os02g0137100` - identity=48.3; qcov=1.02; evalue=3.18e-96; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09713 (A_thal_3526)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990196

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770403.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057770403.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770403.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770403.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16192252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B80
`Chr6:16192701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:16192866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B80
`Chr6:16192898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:16192910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D10
`Chr6:16192922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:16192923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B80
`Chr6:16194216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770403.1

322 aa

161

322

A_thal_3526

PF09713 A_thal_3526 17-68 aa

XP_057770405.1

321 aa

160

321

A_thal_3526

PF09713 A_thal_3526 17-68 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770403.1`	Pfam	`PF09713`	A_thal_3526	Domain	17	68	1.7e-25	89.8	Plant protein 1589 of unknown function (A_thal_3526)
`XP_057770405.1`	Pfam	`PF09713`	A_thal_3526	Domain	17	68	1.7e-25	89.8	Plant protein 1589 of unknown function (A_thal_3526)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090864.1
GTACCTTCCGTATTCGGGATTGTACGTTAATCTGGTAATAAGGAATTTCTTATTGGAAATATTGAGTTTATGGGTAAATCAATAAAATACATGCGAACGCGACCGATTGTGGATTTGTAACAGAGCCCCCATCACTTTCTCGCTCTATCGTTCTCTCTCTAGATTCTCTCTCTGTGTCGATGCTGAAACAAAGCTCTGTGACAAAAACCCAACAAATTACAGGCGGTAAGCAACCGATCATCTTGGAACTCTGTGGCTAA...

XR_009090863.1
GTACCTTCCGTATTCGGGATTGTACGTTAATCTGGTAATAAGGAATTTCTTATTGGAAATATTGAGTTTATGGGTAAATCAATAAAATACATGCGAACGCGACCGATTGTGGATTTGTAACAGAGCCCCCATCACTTTCTCGCTCTATCGTTCTCTCTCTAGATTCTCTCTCTGTGTCGATGCTGAAACAAAGCTCTGTGACAAAAACCCAACAAATTACAGGCGGTAAGCAACCGATCATCTTGGAACTCTGTGGCTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990196
ATGTCAAATGGTGAAGTTAGGAAAGTCTCACTACAGGACATACAATTGGTTCAGAACCTTATAGAAAGATGCCTTCAGCTTTACATGAGCGAGAGGGAAGTTGTGAATACATTGTTACACCAGGCAAAAATTGAGCCCGGCTTCACCGAACTTGTGTGGCAAAAACTTGAAGCAGAAAATCAGGAATTTTTTCGGGCGTATCACCTGAGGCTGATTGTGAAGGACCAGATATTAAGATTCAATCAATTGCTCGAGAGGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770403.1
MSNGEVRKVSLQDIQLVQNLIERCLQLYMSEREVVNTLLHQAKIEPGFTELVWQKLEAENQEFFRAYHLRLIVKDQILRFNQLLERQVELMRQVCQTGVASMSLSNGSQMHSTVHNNSAYQVQQPAGPPIKPENMHQAITLPNVYTNGASTLQPSVQVPVNMSGHAGRIDVPENMLLAQNSNTGIVQGMNGVMIKSEGGFAGDSHFMFGADNNLIEPRNAIGEASVSPFAGGEPGSQALDESMLDQETASFGFLGQIPRN...

XP_057770405.1
MSNGEVRKVSLQDIQLVQNLIERCLQLYMSEREVVNTLLHQAKIEPGFTELVWQKLEAENQEFFRAYHLRLIVKDQILRFNQLLERQVELMRQVCQTGVASMSLSNGSQMHSIHNNSAYQVQQPAGPPIKPENMHQAITLPNVYTNGASTLQPSVQVPVNMSGHAGRIDVPENMLLAQNSNTGIVQGMNGVMIKSEGGFAGDSHFMFGADNNLIEPRNAIGEASVSPFAGGEPGSQALDESMLDQETASFGFLGQIPRNF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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