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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001528`

染色体: Chr06 坐标: 16505408-16509889 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001528`
名称	SmilChr06G001528
描述	transcription factor-like protein DPB
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16505408 - 16509889 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990207`
GeneID	`130990207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990207`
原始查询	`LOC130990207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor-like protein DPB
产物	transcription factor-like protein DPB
Arabidopsis	`AT5G03415` (DPB) Transcription factor DP [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831847] identity=79; qcov=0.79; evalue=7.57e-160; confidence=high
Rice	`Os10g0440100` (Orysa) - identity=71.3; qcov=0.818; evalue=8.14e-145; confidence=high
GO	GO:0000977 (RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0005667 (transcription regulator complex); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0051726 (regulation of cell cycle)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02319 (WHD_E2F_TDP); PF08781 (DP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770415.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770415.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770415.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770415.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16505880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:16506238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:16508389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:16508957`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B103,B26,B7,C11,C31,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770415.1

364 aa

182

364

WHD_E2F_TDP

PF02319 WHD_E2F_TDP 110-192 aa PF08781 DP 200-317 aa

XP_057770416.1

362 aa

181

362

WHD_E2F_TDP

PF02319 WHD_E2F_TDP 108-190 aa PF08781 DP 198-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770415.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	110	192	1.5e-19	70.2	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057770415.1`	Pfam	`PF08781`	DP	Domain	200	317	3.8e-39	134.4	Transcription factor DP
`XP_057770416.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	108	190	1.5e-19	70.2	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057770416.1`	Pfam	`PF08781`	DP	Domain	198	315	3.7e-39	134.5	Transcription factor DP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914433.1
AAAACTACTTAAATAAGTAGTCAAAGAAAAAGAAAACCACTTCCCTCTACGATTCTTTGCTTGAGAGTGTCGCACTCCTCTTTTTCTTTTTCCCTTTCGACAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCTTTTGGCACTTACTGAACAAATTTTCACAAGCTTTTTTAATCTGGGTTTCTAGGTTTTCCGGTCATACTTTGACGACATTAGAGTAAAAATTAGAACAGCACATCAGCATTGCACCACTGTTTGCAGCTGATTTA...

XM_057914432.1
AAAACTACTTAAATAAGTAGTCAAAGAAAAAGAAAACCACTTCCCTCTACGATTCTTTGCTTGAGAGTGTCGCACTCCTCTTTTTCTTTTTCCCTTTCGACAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCTTTTGGCACTTACTGAACAAATTTTCACAAGCTTTTTTAATCTGGGTTTCTAGGTTTTCCGGTCATACTTTGACGACATTAGAGTAAAAATTAGAACAGCACATCAGCATTGCACCACTGTTTGCAGCTGATTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990207
ATGGGGAATCATAGCAACAACAACAGTAGCAATCAAGAAGATGGGAATAAGAACTCATCAACGGTTTCTAAAGGCAGTGGTGGTTTAGGTGGAGCCACCAGGTCATGGGGTACCACCGTCTCCGGTGGTCAATCCATGTCAACTAGCGGTAGCGTGGGGTCGCCTTCCAGCCGGAGTGAGGCTGCGATGGCTACTACGGTCAGTGATAGCGCAATAATGCGGATGAACAACCTTGATATCCAAGGAGATGATGCAGGGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770415.1
MGNHSNNNSSNQEDGNKNSSTVSKGSGGLGGATRSWGTTVSGGQSMSTSGSVGSPSSRSEAAMATTVSDSAIMRMNNLDIQGDDAGSQGTAGNRKKKRGQRAVGGDKSGRGLRQFSMKVCEKVESKGRTTYNEVADELVAEFSDPNNSLASPDQSQQQYDEKNIRRRVYDALNVLMAMDIISKDKKEIQWKGLPRTSLDDIEELKTERLGVRSRIEKKAAYLEELEEQYVGLQNLIQRNKQLYGSGNTPTGGVALPFILV...

XP_057770416.1
MGNHSNNNSSNQEDGNKNSSTVSKGSGGLGGATRSWGTTVSGGQSMSTSGSVGSPSSRSEAAMATTVSDSAIMRMNNLDIQGDDAGSQGTAGKKKRGQRAVGGDKSGRGLRQFSMKVCEKVESKGRTTYNEVADELVAEFSDPNNSLASPDQSQQQYDEKNIRRRVYDALNVLMAMDIISKDKKEIQWKGLPRTSLDDIEELKTERLGVRSRIEKKAAYLEELEEQYVGLQNLIQRNKQLYGSGNTPTGGVALPFILVQT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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