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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001544`

染色体: Chr06 坐标: 16741051-16744523 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001544`
名称	SmilChr06G001544
描述	uncharacterized SmilChr06G001544
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16741051 - 16744523 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990222`
GeneID	`130990222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990222`
原始查询	`LOC130990222`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842558]; symbol=AT1G62610; hit=AT1G62610; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842558]; symbol=AT1G62610; hit=AT1G62610; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G62610` (AT1G62610) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842558] identity=53; qcov=1.05; evalue=5.42e-94; confidence=high
Rice	`Os08g0510400` - identity=56.2; qcov=1.01; evalue=3.19e-85; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770432.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770432.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057770432.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770432.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770432.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16741114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr6:16741126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B26,C1,C20
`Chr6:16741135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C18,C63
`Chr6:16741214`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,A24,B102,B119,B136,B36,B4,B72,B74,B81,C13,C42
`Chr6:16741295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr6:16741303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:16741307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr6:16741334`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr6:16741334`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr6:16741346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B101,B14,B2,B93,C34,C75
`Chr6:16741347`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B46
`Chr6:16741347`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770432.1

270 aa

135

270

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 17-222 aa PF08659 KR 19-190 aa PF13561 adh_short_C2 26-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770432.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	17	222	8.3e-42	143.6	short chain dehydrogenase
`XP_057770432.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	19	190	4.5e-08	33.9	KR domain
`XP_057770432.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	26	259	1.8e-31	110.2	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914449.1
ATGGAAATCCTACACCAATTTGAGCCATGGTCTACTCACCTCGATGGAAAAATTGTCATGGTCACCGGCGCTTCCGCCGGCCCCGGCCTCGACTTCTGCCTCGACCTCGCTCGGGCTGGCTGCAGAGTCGTGGTCGCAGCCGTACGTAGAACCGACCTCCTCAAGTCCCTCTGCGATCAGATCAGTATTGCAATGGAAGCACCCGATGGCAGCGGCTCGTGTCAAGCTATCGCGGTGGAGCTCGACGTTGCTGCCGACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990222
ATGGAAATCCTACACCAATTTGAGCCATGGTCTACTCACCTCGATGGAAAAATTGTCATGGTCACCGGCGCTTCCGCCGGCCCCGGCCTCGACTTCTGCCTCGACCTCGCTCGGGCTGGCTGCAGAGTCGTGGTCGCAGCCGTACGTAGAACCGACCTCCTCAAGTCCCTCTGCGATCAGATCAGTATTGCAATGGAAGCACCCGATGGCAGCGGCTCGTGTCAAGCTATCGCGGTGGAGCTCGACGTTGCTGCCGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770432.1
MEILHQFEPWSTHLDGKIVMVTGASAGPGLDFCLDLARAGCRVVVAAVRRTDLLKSLCDQISIAMEAPDGSGSCQAIAVELDVAADSSTIEANVERAWAAFGSIDALINNAGLRGQVKSSLELSEEEWDRVVKTNLRGSWLVWKYVGERMRRRGACGSVINISSIAGLNGFTVSGGIAYTASKTGLNSMTKIMALELGEYCIRLNSSAPALFKSEITEELLRKQMFQKFGTTDHALTSLIRYLIHYSSNYVTGNIFIADS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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