当前解析结果
SmilChr01G003137| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003137 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003137 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003137 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 50162417 - 50164538 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990267 |
|---|---|
| GeneID | 130990267 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990267 |
| 原始查询 | LOC130990267 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990267 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057770485.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057770485.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057770485.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057770485.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770485.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:50163782 |
TCA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A14,A15,A6,B100,B12,B123,B124,B19,B20,B3,B30,B42,B43,B5,B51,B52,B54,B55,B60,B64,B71,B78,B84,B91,C14,C22,C32,C38,C4,C48,C54,C55,C56,C57,C68,C75,C83 |
Chr1:50164056 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B49 |
Chr1:50164056 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr1:50164078 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr1:50164078 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:50164202 |
GAC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 92 | A1,A14,A15,A18,A6,A8,B100,B101,B103,B104,B109,B114,B119,B12,B123,B124,B125,B131,B138,B19,B2,B23,B28,B3,B30,B32,B33,B38,B39,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B62,B63,B64,B67,B71,B73,B76,B78,B79,B82,B84,B85,B87,B90,B91,B92,B93,B96,B98,C10,C11,C14,C15,C16,C2,C22,C30,C32,C37,C38,C4,C40,C48,C53,C54,C55,C56,C57,C62,C68,C69,C71,C74,C75,C8,C83,C9,D10,D11,D3,D7 |
Chr1:50164205 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 92 | A1,A14,A15,A18,A6,A8,B100,B101,B103,B104,B109,B114,B119,B12,B123,B124,B125,B131,B138,B19,B2,B23,B28,B3,B30,B32,B33,B38,B39,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B62,B63,B64,B67,B71,B73,B76,B78,B79,B82,B84,B85,B87,B90,B91,B92,B93,B96,B98,C10,C11,C14,C15,C16,C2,C22,C30,C32,C37,C38,C4,C40,C48,C53,C54,C55,C56,C57,C62,C68,C69,C71,C74,C75,C8,C83,C9,D10,D11,D3,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。