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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001596`

染色体: Chr06 坐标: 17712416-17715836 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001596`
名称	SmilChr06G001596
描述	thaumatin-like protein
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	17712416 - 17715836 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990268`
GeneID	`130990268`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990268`
原始查询	`LOC130990268`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thaumatin-like protein
产物	thaumatin-like protein
Arabidopsis	`AT1G73620` (AT1G73620) Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843696] identity=76.4; qcov=0.745; evalue=1.23e-130; confidence=high
Rice	`Os06g0691200` - identity=64; qcov=0.791; evalue=6.42e-112; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990268

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057770483.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057770483.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770483.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770483.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770483.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:17712537`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	66	A18,A19,A2,A20,A21,A3,B1,B101,B107,B113,B12,B128,B130,B132,B135,B136,B14,B17,B2,B24,B25,B26,B27,B33,B38,B39,B40,B44,B47,B50,B51,B59,B68,B69,B77,B84,B91,C1,C14,C15,C18,C19,C2,C24,C29,C31,C32,C37,C4,C40,C42,C5,C55,C57,C6,C61,C62,C68,C74,C75,C77,C8,C87,D3,D4,D9
`Chr6:17712909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:17712948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B56,B96,C84
`Chr6:17712978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B37
`Chr6:17712984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:17713059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:17715366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr6:17715451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr6:17715456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B84
`Chr6:17715486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C23
`Chr6:17715558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:17715608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770483.1

302 aa

151

302

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 88-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770483.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	88	299	5.8e-82	275.1	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914500.1
ATGAAACATCAAACCTGTTAGTATATTGGATTACAAGTGCATTCGCTTTTATAATTTGCATTAATGGTGATAAAATGTGAGAGAACTTATAATTTTCTTCAAAAATATCGCAACCCTTTTTTCCCTTTTTTGCCTATAAAATCCCATCCAACAAATTCATCAATACATGAGCAGCGTCACAACTTTCCAACTCAAGCACAAACTCTGCTTCACTCTTCCGCCGCCATGGATGGCTCTCTCAAACCTCTCTTCTCTCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990268
ATGGTGATAAAATGTGAGAGAACTTATAATTTTCTTCAAAAATATCGCAACCCTTTTTTCCCTTTTTTGCCTATAAAATCCCATCCAACAAATTCATCAATACATGAGCAGCGTCACAACTTTCCAACTCAAGCACAAACTCTGCTTCACTCTTCCGCCGCCATGGATGGCTCTCTCAAACCTCTCTTCTCTCTCCTCTTTCTCTCCCTCCTCACACTCCACATTTCAGTGGAGGTATCAGGTACAACAATGACGTTGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770483.1
MVIKCERTYNFLQKYRNPFFPFLPIKSHPTNSSIHEQRHNFPTQAQTLLHSSAAMDGSLKPLFSLLFLSLLTLHISVEVSGTTMTLYNKCSHPVWPGIQPGSGSPVLAKGGFKLPPNKSYTLQLPAAWSGRVWGRHGCSFDKTGRGRCATGDCGGALFCNGLGGTPPATLAEITLGNDQDFYDVSLVDGYNLAISITPFRGKGKCSYAGCVSDLNMMCPVGLQVRSHDKKRVVACKSACFAFNSPRYCCTGSFGNPQSCK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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