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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003139`

染色体: Chr01 坐标: 50199028-50202879 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003139`
名称	SmilChr01G003139
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 34-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50199028 - 50202879 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990295`
GeneID	`130990295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990295`
原始查询	`LOC130990295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 34-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 34-like
Arabidopsis	`AT1G17280` (UBC34) ubiquitin-conjugating enzyme 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838300] identity=68.3; qcov=1.01; evalue=1.05e-120; confidence=high
Rice	`Os06g0193000` (OsUBC46) - identity=60.3; qcov=1.02; evalue=1.48e-105; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057770498.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057770498.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770498.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770498.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770498.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50199397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:50200227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770498.1

237 aa

118

237

UQ_con

PF00179 UQ_con 9-122 aa

XP_057770504.1

237 aa

118

237

UQ_con

PF00179 UQ_con 9-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770498.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	9	122	2.6e-18	66.7	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057770504.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	9	122	2.6e-18	66.7	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914515.1
CGTCTTTTAATCCCAAAAAGAAATTCACAATTTAAGATCAAAATTTTCTCTTCTGCTCAAATTCAACGCGTTGGAATTTTATCGAATCAAAAGATTTCGTAAAATTGTACGAATTAGTATTATCTGAGATGAAAAATTAGCTGGAAGTTGAACTCTGTTGAAGGTTTTTCGTTCAATTGTTCGTTTGAATTGGGTTTTCAAACTCTGCAGGGAACATTCTATTAGAGACAGTGGACAGGATTAATATTCCGCGCAAGCTA...

XM_057914521.1
TCTTTTAATCCCAAAAAGAAATTCACAATTTAAGATCAAAATTTTCTCTTCTGCTCAAATTCAACGCGTTGGAATTTTATCGAATCAAAAGATTTCGTAAAATTGTACGAATTAGTATTATCTGAGATGAAAAATTAGCTGGAAGTTGAACTCTGTTGAAGGTTTTTCGTTCAATTGTTCGTTTGAATTGGGTTTTCAAACTCTGGGAACATTCTATTAGAGACAGTGGACAGGATTAATATTCCGCGCAAGCTACCTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990295
ATGACTGACAAAGCGTGTTTAAAGCGCCTCCAAAAGGAATATAGAGCTCTATGTAAAGAACCTGTCTCCAATGTGGTGGCACGCCCTCTGCCAAATGACATCCTTGACTGGCATTATGTTTTGGAGGGAAGTCAAGGAACACCCTTTGCAGGGGGATATTATTATGGAAAAATAAAGTTTCCACCAGATTACCCATTTAAACCTCCATCAATCACTATGACTACTCCAAATGGACGCTTTATGACACAAAAGAAGTTATG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770498.1
MTDKACLKRLQKEYRALCKEPVSNVVARPLPNDILDWHYVLEGSQGTPFAGGYYYGKIKFPPDYPFKPPSITMTTPNGRFMTQKKLCLSMSDYHPESWNPMWSVSSILNGLLSFMMDNSPTTGSVSSTEEEKKRLASASLAFNCKNPTFRKLFPEYVEKYEQQLATEQSADQAAQESVRDENSRPTLKKRGSKVDPNNVDIPNEVNNQQKRQSFPTWLSLMLVCIFAAVMALPLLQL

XP_057770504.1
MTDKACLKRLQKEYRALCKEPVSNVVARPLPNDILDWHYVLEGSQGTPFAGGYYYGKIKFPPDYPFKPPSITMTTPNGRFMTQKKLCLSMSDYHPESWNPMWSVSSILNGLLSFMMDNSPTTGSVSSTEEEKKRLASASLAFNCKNPTFRKLFPEYVEKYEQQLATEQSADQAAQESVRDENSRPTLKKRGSKVDPNNVDIPNEVNNQQKRQSFPTWLSLMLVCIFAAVMALPLLQL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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