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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001640`

染色体: Chr06 坐标: 18495607-18500657 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001640`
名称	SmilChr06G001640
描述	uncharacterized GPI-anchored protein At4g28100
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18495607 - 18500657 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990300`
GeneID	`130990300`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990300`
原始查询	`LOC130990300`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GPI-anchored protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821330]; symbol=AT3G18050; hit=AT3G18050; species=arabidopsis; confidence=high
产物	GPI-anchored protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821330]; symbol=AT3G18050; hit=AT3G18050; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G18050` (AT3G18050) GPI-anchored protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821330] identity=50.6; qcov=1.04; evalue=9.22e-105; confidence=high
Rice	`Os07g0557700` - identity=40.3; qcov=0.694; evalue=6.45e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF19160 (SPARK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990300

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770500.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770500.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770500.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770500.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770500.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18496060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:18496186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B27,B30,B57,B61
`Chr6:18496268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:18496300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B45,B53
`Chr6:18496321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B27,B30,B57,C35
`Chr6:18496414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:18496486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:18496535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:18496558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C23,C8
`Chr6:18500197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C46,C48
`Chr6:18500213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,C34,C46,C75
`Chr6:18500234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770500.1

333 aa

166

333

SPARK

PF19160 SPARK 56-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770500.1`	Pfam	`PF19160`	SPARK	Domain	56	247	4.8e-10	40.7	SPARK

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914517.1
GAAAGAACAAAAATTATTATTTGCTCGTCATTTACTAATCTATTATCACCAAAGATTGGAAGGACCGAATTTAACACAAGTAATTAAATGACCCACAACACAATTGTCCAAACATAAATGTACTATAGGAGTATTAAACAATCTAACTTTATCCAACCCCCACCTCTTCTCCACCCCTTTACTACTACACCCCCACCACCAATCCATCAAAAAAAAAAAAAAGCACTCCAACAAACAATACCACACTTCACTTCTCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990300
ATGTTCCAAGGTAACATATTCTTGCTCACTTTCCTCTTCCTCACATTCCACCCCCTGCCCGTACCCGCCCTCCCCATCCTACCCGACCCGGACCCGGCCTCCGTCCAGACCCAAACCCTCCACCGCCCCCCGCCGGCCACCATCCCCGCCTTCCCGGAGCAATCCGAGGCCTCCGGCTGCCCCCTCAACCTCCCCGACCAGCTCTTCCGCGACATCAAATCCGCCTGCGGCGCCCGCCCCCACCACCGCCCCGACCCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770500.1
MFQGNIFLLTFLFLTFHPLPVPALPILPDPDPASVQTQTLHRPPPATIPAFPEQSEASGCPLNLPDQLFRDIKSACGARPHHRPDPSSYSGQLHRSRCCPVLAAWLYSAYSDTALRPTAAKSPPQTASYEMPVLPDDSETCVDSLEKALGGRDIELRRPNDTCDVVYCYCGIRLHPFSCSEAFRVNSRGKLVGGEAVEKLERDCSAAGGGGLGGCSKCLDSLYLLNGERDRRSNRTERTNKMHNQDCELMGLTWLLNKDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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