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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001647`

染色体: Chr06 坐标: 18667422-18674851 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001647`
名称	SmilChr06G001647
描述	peroxisome biogenesis protein 3-2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18667422 - 18674851 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990307`
GeneID	`130990307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990307`
原始查询	`LOC130990307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisome biogenesis protein 3-2-like
产物	peroxisome biogenesis protein 3-2-like
Arabidopsis	`AT1G48635` (PEX3) peroxin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841285] identity=49.9; qcov=0.992; evalue=2.22e-130; confidence=high
Rice	`Os09g0314300` - identity=45.4; qcov=1; evalue=8.95e-115; confidence=high
GO	GO:0005778 (peroxisomal membrane); GO:0030674 (protein-macromolecule adaptor activity); GO:0045046 (protein import into peroxisome membrane)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04882 (Peroxin-3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057770510.1`
2	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	1.00000	`XP_057770510.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770510.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770510.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18667676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B90,B92
`Chr6:18667733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C46
`Chr6:18668476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C42
`Chr6:18670860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,C34,C75
`Chr6:18670868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr6:18670893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:18673741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr6:18674007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B30,B57,C35
`Chr6:18674081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:18674094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:18674120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770510.1

368 aa

184

368

Peroxin-3

PF04882 Peroxin-3 103-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770510.1`	Pfam	`PF04882`	Peroxin-3	Family	103	365	3.6e-29	102.9	Peroxin-3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914527.1
TTTTTTTTTGGCTGAGAAGATAGTAGACATCAATTATATACTGATACAGTGGCATAAATAATTGATGAGTAGATTTTAGTTTCAGTTAAAATTTTGATATCGAATCATCGATGTATTAAAAGTGATGATTTTTGTAGCAGCTTAAAATTTTTATCTTTCACTCATCACAGATTCCAAAGTGCAAACCGCGGATAAAAGCAAAAAGGCAAATAACCCAAGATTCGAGCTCTGATTAGAACACAAAAATAGAAAGATAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990307
ATGTGGCAATTTTGGAGAAGGCATAAGAGAAAAGTGTATGTTGCACTTGGAGCTTTTGGGGGCGGGTATCTACTGTACAGGCTCTATGATGCTCGGAGGCATAGTCTTATTGCTCTTCAGAGGCAGCTTGCTGATGAGAGGGAAAGTGAGGAACTCATTAAAGCCCAAATACAATCACATTTTCAGAGCGTCCAGAGAATAGCTGATTCAGCAACGCTGCCTCATGTGATGCATTTCTTAGATATTCATTTGGCCGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770510.1
MWQFWRRHKRKVYVALGAFGGGYLLYRLYDARRHSLIALQRQLADERESEELIKAQIQSHFQSVQRIADSATLPHVMHFLDIHLAEHLDLTPLTERLIQGKDQANALTKTEKLELWDRLKILSFTKMVSSIWALTMLSLYIRVQVNILGRHLYIDTARGLGSSHLLDEAEMIDKNDEQQFLACADYLSNHGLLSLISGTEAVTSEVLKGKHLKDIFNTSLVHDTIIRILDTLMIRHSPSQWVGYLMPEDGDVYKFVAPSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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