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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001653`

染色体: Chr06 坐标: 18736140-18737922 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001653`
名称	SmilChr06G001653
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18736140 - 18737922 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990313`
GeneID	`130990313`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990313`
原始查询	`LOC130990313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
产物	alpha-1%2C3-arabinosyltransferase XAT3-like
Arabidopsis	`AT3G18180` (AT3G18180) Glycosyltransferase family 61 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821345] identity=40.8; qcov=1.01; evalue=8.75e-97; confidence=medium
Rice	`Os03g0567600` (OsXAT3) - identity=40.8; qcov=1.01; evalue=2.29e-90; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04577 (Glyco_transf_61)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990313

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057770515.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057770515.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770515.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770515.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18736866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B57
`Chr6:18736942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B27,B30,B57,C35
`Chr6:18737378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B90,C14
`Chr6:18737439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B93,C22
`Chr6:18737445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B86,C31,C65
`Chr6:18737451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B82,D4
`Chr6:18737583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C14,D11
`Chr6:18737586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,C14,C22,D11
`Chr6:18737763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B71,C46,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770515.1

380 aa

190

380

Glyco_transf_61

PF04577 Glyco_transf_61 80-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770515.1`	Pfam	`PF04577`	Glyco_transf_61	Family	80	286	8.1e-12	46.3	Glycosyltransferase 61

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914532.1
TTCAAGTTATTGTGAAATGGAGGGTGACATAAGGGTTGAAGCCAAATCCTCAACAATAGTCATCGTAACACCTCTCGATAGCGTCTACTCATCCACCATTGAGCCTTATCCCCGACCCAAATCGCGCCGCGTCAAGAAATGGAGACTCACAACCCACCAACACAACGTCCCCAGATGCACCCAACATCACAACCATCCCGCAATCCTCTTCTCAATTTCTGGATTCACAGGATCAAAGACACAACGCGGAAATTACTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990313
ATGGAGGGTGACATAAGGGTTGAAGCCAAATCCTCAACAATAGTCATCGTAACACCTCTCGATAGCGTCTACTCATCCACCATTGAGCCTTATCCCCGACCCAAATCGCGCCGCGTCAAGAAATGGAGACTCACAACCCACCAACACAACGTCCCCAGATGCACCCAACATCACAACCATCCCGCAATCCTCTTCTCAATTTCTGGATTCACAGGATCAAAGACACAACGCGGAAATTACTTCCACGACTTCGCCGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770515.1
MEGDIRVEAKSSTIVIVTPLDSVYSSTIEPYPRPKSRRVKKWRLTTHQHNVPRCTQHHNHPAILFSISGFTGSKTQRGNYFHDFADVLFPLYMTSSRFQGEVHFLATDYKPLWIRQYTHILNKLTKHNILDIDAQTSQVHCYHNMQLGLTFYNVLMSPPSSPLSPPSPSMHTFRQLLRETYSLKRESATILNVAKPRARPADYLVVSPPRPRLMIIDRKQYRVIRNAGQVSSMAAGMGFEVVVADAGRSTEMWRVAEAVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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