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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001685`

染色体: Chr06 坐标: 19144121-19149118 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001685`
名称	SmilChr06G001685
描述	uncharacterized SmilChr06G001685
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19144121 - 19149118 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990343`
GeneID	`130990343`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990343`
原始查询	`LOC130990343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0456B03.103; symbol=P0456B03.103; hit=Os08g0424700; species=rice; confidence=low
产物	P0456B03.103; symbol=P0456B03.103; hit=Os08g0424700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=33.5; qcov=0.385; evalue=1.57e-40; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=30.2; qcov=0.413; evalue=3.96e-44; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990343

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770547.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770547.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770547.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770547.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19144737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B90,B92
`Chr6:19144773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C75
`Chr6:19144794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B26,C42
`Chr6:19144802`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B90,C83
`Chr6:19144802`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B90,C83
`Chr6:19144883`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	109	A1,A10,A15,A16,A20,A22,A23,A25,A3,A4,A6,B10,B100,B103,B104,B105,B106,B109,B112,B118,B120,B121,B13,B131,B139,B14,B15,B2,B22,B26,B29,B3,B30,B37,B40,B43,B47,B48,B49,B52,B56,B57,B59,B60,B61,B66,B69,B71,B73,B74,B75,B77,B79,B82,B87,B94,B95,B96,B99,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C2,C20,C21,C24,C25,C29,C30,C32,C33,C36,C38,C39,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C52,C54,C59,C60,C63,C65,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C78,C79,C81,C82,D2,D3,D5,D6,D7,D8
`Chr6:19144903`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B90,C83
`Chr6:19144903`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B90,C83
`Chr6:19144929`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	40	A15,A16,B100,B104,B118,B120,B121,B130,B135,B2,B25,B40,B43,B54,B60,B61,B63,B65,B71,B76,B83,B93,B96,C11,C16,C2,C24,C25,C26,C29,C31,C47,C50,C52,C54,C57,C65,C69,C83,D6
`Chr6:19144940`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A15,A16,B100,B104,B118,B120,B121,B130,B2,B23,B25,B40,B42,B43,B54,B6,B60,B61,B63,B65,B71,B76,B83,B93,B96,C11,C16,C2,C24,C25,C26,C29,C31,C47,C50,C52,C54,C57,C64,C65,C66,C69,C83,D6
`Chr6:19144947`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	45	A15,A16,A23,B100,B104,B105,B118,B120,B121,B130,B140,B2,B23,B42,B43,B54,B58,B6,B60,B61,B63,B65,B71,B83,B84,B93,B95,B96,C11,C16,C24,C26,C29,C34,C47,C50,C52,C54,C64,C65,C66,C69,C84,D3,D6
`Chr6:19144950`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	55	A11,A15,A16,A2,A23,B100,B104,B105,B118,B120,B121,B130,B140,B2,B23,B24,B28,B42,B43,B46,B53,B54,B58,B6,B60,B61,B63,B65,B66,B71,B83,B84,B93,B94,B95,B96,C11,C16,C24,C26,C29,C33,C34,C47,C50,C52,C54,C58,C64,C65,C66,C69,C84,D3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770547.1

753 aa

376

753

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 160-297 aa PF00931 NB-ARC 414-582 aa PF23559 WHD_DRP 665-729 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770547.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	160	297	2e-56	191.0	NB-ARC domain
`XP_057770547.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	414	582	2e-56	191.0	NB-ARC domain
`XP_057770547.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	665	729	7.6e-14	52.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914564.1
GTAACAAAAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATTGCATATCGGCACAGCTCCTAAATCGGAAGAGAAACAGGAGATGGCTTATGCTGCTGTGATTTCTCTTAAGCAAACTATACATCACCTCCTAAATTCTTCTCATATTTCCATCCACTCTCCTAGTCGAGAAACCTTACAAGCTGCATACAAACAGCTCACATCCTTACAAGAGGCGCTCACACGATCCGACGACGACACCAGCAGCACTAGGAGAAACAGATTGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990343
ATGGCTTATGCTGCTGTGATTTCTCTTAAGCAAACTATACATCACCTCCTAAATTCTTCTCATATTTCCATCCACTCTCCTAGTCGAGAAACCTTACAAGCTGCATACAAACAGCTCACATCCTTACAAGAGGCGCTCACACGATCCGACGACGACACCAGCAGCACTAGGAGAAACAGATTGAACGCCATCGACACACAAATCAGAGAGGCCGTTCATCAATTACAAGACTCACTCGAATCCCATGCCTCACACCACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770547.1
MAYAAVISLKQTIHHLLNSSHISIHSPSRETLQAAYKQLTSLQEALTRSDDDTSSTRRNRLNAIDTQIREAVHQLQDSLESHASHHFQHPALPPLHLEFTSQEIISFAQAANKMEKAYVQELQNPNFQDDDRDSAATLPIHNSAVKMVGLSDAIADIKDHVLRILRPDYYGVFTFFGDAGNGRSIVARGVYDDVYVGGERAFDCGAWVRIGSTYQLKQILLNIIAQINKIDREYLSSEGEEELGEHLCASLRGRRYIVVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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