当前解析结果
SmilChr06G001707| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001707 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001707 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001707 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 19615532 - 19617816 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990358 |
|---|---|
| GeneID | 130990358 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990358 |
| 原始查询 | LOC130990358 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os02g0328500- identity=34.6; qcov=0.775; evalue=1.58e-27; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990358 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770560.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770560.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770560.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770560.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057770560.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:19616914 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B4,D5 |
Chr6:19616928 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr6:19616992 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B47,C46 |
Chr6:19616992 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B47,C46 |
Chr6:19617002 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr6:19617066 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr6:19617073 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr6:19617074 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A22,B106,B62,B83,C19,C24 |
Chr6:19617120 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr6:19617123 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,B109,B20 |
Chr6:19617138 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr6:19617169 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C42 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。