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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001735`

染色体: Chr06 坐标: 20011098-20015799 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001735`
名称	SmilChr06G001735
描述	uncharacterized SmilChr06G001735
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20011098 - 20015799 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990386`
GeneID	`130990386`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990386`
原始查询	`LOC130990386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0638800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os12g0638800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G39940` (AT5G39940) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833991] identity=64.1; qcov=0.858; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0638800` - identity=64.3; qcov=0.865; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF03486 (HI0933_like); PF22780 (HI0933_like_1st)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770609.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770609.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770609.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770609.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770609.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20012143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C10
`Chr6:20012143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr6:20012273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr6:20013655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B139,B32,C4
`Chr6:20013717`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A18,A19,B102,B105,B132,B138,B14,B27,B31,B33,B45,B46,B5,B62,B69,B70,B92,C1,C22,C23,C37,C39,C49,C5,C55,C76,C9
`Chr6:20013923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:20015419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C57
`Chr6:20015431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770609.1

480 aa

240

480

HI0933_like

FAD_binding_2

HI0933_like_1st

PF03486 HI0933_like 52-464 aa PF00890 FAD_binding_2 53-104 aa PF22780 HI0933_like_1st 241-411 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770609.1`	Pfam	`PF03486`	HI0933_like	Domain	52	464	1.1e-64	218.9	HI0933-like protein Rossmann domain
`XP_057770609.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	53	104	4.9e-05	23.4	FAD binding domain
`XP_057770609.1`	Pfam	`PF22780`	HI0933_like_1st	Family	241	411	5.6e-34	118.0	HI0933-like protein barrel and H2TH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914626.1
GACCATTTTATCATTGCTCTGCTACTCTGCCTCCTCAAAACCACACTGCAAGATGAACACATGTTTCCCGCGGTTTCTTCTCCAAGCTGAGTTCCTCTCAAGAATCTCACTTCCGCCAAAAAATTGTGCTTATGTTCTTCTCTCCAACCGGAAAAGAAGATATTGCGCGATTGTCCTCTCGTTGTCTGCCAAGCCAACTAAGGAAACGCTGGTGGTAGTAGGCGGCGGAGCGGCCGGCATTTATGGAGCGATTAGAGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990386
ATGAACACATGTTTCCCGCGGTTTCTTCTCCAAGCTGAGTTCCTCTCAAGAATCTCACTTCCGCCAAAAAATTGTGCTTATGTTCTTCTCTCCAACCGGAAAAGAAGATATTGCGCGATTGTCCTCTCGTTGTCTGCCAAGCCAACTAAGGAAACGCTGGTGGTAGTAGGCGGCGGAGCGGCCGGCATTTATGGAGCGATTAGAGCGAAAACGGTTGCGCCTGACCTCAATGTTGTTGTTATGGAGAAAGGAAAGCCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770609.1
MNTCFPRFLLQAEFLSRISLPPKNCAYVLLSNRKRRYCAIVLSLSAKPTKETLVVVGGGAAGIYGAIRAKTVAPDLNVVVMEKGKPLSKVKISGGGRCNVTNGSYTDNVVLAGNYPRGNKELRGSFFNVHGPNDTMSWFSDRGVELKTELDGRVFPVTDSSSTIIDCLMSEARRRGVVLETGKTVTSVSAIDGCKFSIKVEKRTVDYVEYAEANYLMIASGSSEQGYKLAAQLGHSIVKPVPSLFTFKIDDFQLVELSGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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