当前解析结果
SmilChr01G003148| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003148 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003148 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003148 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 50291613 - 50292790 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990392 |
|---|---|
| GeneID | 130990392 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990392 |
| 原始查询 | LOC130990392 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | LL-diaminopimelate aminotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820648]; symbol=AT3G14280; hit=AT3G14280; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | LL-diaminopimelate aminotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820648]; symbol=AT3G14280; hit=AT3G14280; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G14280 (AT3G14280)LL-diaminopimelate aminotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820648] identity=56.7; qcov=0.492; evalue=1.79e-16; confidence=low |
| Rice | Os06g0193300- identity=58.3; qcov=0.393; evalue=2.69e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990392 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057770615.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057770615.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057770615.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770615.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770615.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:50291922 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B14,C26,C77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。