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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000680`

染色体: Chr06 坐标: 6012147-6013052 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000680`
名称	SmilChr06G000680
描述	uncharacterized SmilChr06G000680
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6012147 - 6013052 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990407`
GeneID	`130990407`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990407`
原始查询	`LOC130990407`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=53.9; qcov=0.388; evalue=3.8e-28; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=61.2; qcov=0.933; evalue=5.56e-112; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990407

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770628.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770628.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770628.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770628.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770628.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6012167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B95
`Chr6:6012171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C39,C45
`Chr6:6012182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr6:6012183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C24
`Chr6:6012185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr6:6012202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6012309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:6012317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B58,C43,C46,C85
`Chr6:6012317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,C43,C46,C85
`Chr6:6012341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C34
`Chr6:6012359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C85
`Chr6:6012378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C23,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770628.1

268 aa

134

268

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 82-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770628.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	82	249	2.4e-75	253.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914645.1
ATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTATTGGCCGCTTAAGCTTCTCCCCGATCCAGAAGTGCACTACCGCTATTCGACAATTGGCATACGGAACTGCTGCTGATTGTTGTGACGAATATCTCCGTATAGGAGAGACGACGGCGTTGGAATGCTTGAAGAAATTCTGCAAGGCCATCGTTCGTATCTTTGGCGGCACGTATTTGAGGCGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990407
ATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTATTGGCCGCTTAAGCTTCTCCCCGATCCAGAAGTGCACTACCGCTATTCGACAATTGGCATACGGAACTGCTGCTGATTGTTGTGACGAATATCTCCGTATAGGAGAGACGACGGCGTTGGAATGCTTGAAGAAATTCTGCAAGGCCATCGTTCGTATCTTTGGCGGCACGTATTTGAGGCGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770628.1
MSRELFLRIVNALEVDPYFQQRPDAIGRLSFSPIQKCTTAIRQLAYGTAADCCDEYLRIGETTALECLKKFCKAIVRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEAVVHFLANNSHHTRGYYLTDGIYPDWPVFVKSFQFPNDEKKRRFKVMQEAARKDVERAFGVLQARWGGNASNFDGDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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