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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003153`

染色体: Chr01 坐标: 50323980-50325207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003153`
名称	SmilChr01G003153
描述	protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50323980 - 50325207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990414`
GeneID	`130990414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990414`
原始查询	`LOC130990414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21, mitochondrial-like
产物	protein SENESCENCE-ASSOCIATED GENE 21%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G15910` (DI21) drought-induced 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827273] identity=34.5; qcov=0.978; evalue=3.86e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0564600` (OsLEA10) - identity=70.3; qcov=0.416; evalue=3.34e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03242 (LEA_3a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770635.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770635.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770635.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770635.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770635.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50324131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B117,B73,C24,C65
`Chr1:50324146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C15,C32,C68
`Chr1:50324228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:50324232`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:50324232`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:50324287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:50325046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C80
`Chr1:50325058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B69,B7,C24,C30,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770635.1

89 aa

LEA_3a

PF03242 LEA_3a 7-81 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770635.1`	Pfam	`PF03242`	LEA_3a	Family	7	81	1.1e-18	68.2	Late embryogenesis abundant protein (LEA_3a subfamily)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914652.1
TACAACTCAAAATTCCCCTCTATCTCATTATCTATGTATAAATAAACCATTTCCCTTTTAAACCCTAGAAACTCTATACAAACATATACTTATTATAATATATATCATCAGCCACCATCTACATTTTTTTGGTCTGCAACTATGGTGAAGATTTTGAGCAGCCTTTTCTTGACGAGGAGAGCATACTCCGTCACAGCGGAGAATGTAAGAGTCGGGCTGATGGCACCGGCCATTAGAAAGGCGGCGACGGTAGAGGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990414
ATGGTGAAGATTTTGAGCAGCCTTTTCTTGACGAGGAGAGCATACTCCGTCACAGCGGAGAATGTAAGAGTCGGGCTGATGGCACCGGCCATTAGAAAGGCGGCGACGGTAGAGGCCGAGGGCAACACGGTGGCTAAAGAAGCATTTTGGATGAGAGATCCCAACACAGGAAACTGGATACCTGAGAATCACTTCGGAGAAGTTGATGTTGCAGAACTCAGATCCAAGCTCCTCTCCAAGAAGACCACTTCCTCATCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770635.1
MVKILSSLFLTRRAYSVTAENVRVGLMAPAIRKAATVEAEGNTVAKEAFWMRDPNTGNWIPENHFGEVDVAELRSKLLSKKTTSSSPSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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