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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000823`

染色体: Chr01 坐标: 17759797-17760735 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000823`
名称	SmilChr01G000823
描述	uncharacterized SmilChr01G000823
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17759797 - 17760735 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990417`
GeneID	`130990417`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990417`
原始查询	`LOC130990417`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=25.1; qcov=0.869; evalue=5.31e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=25.3; qcov=0.939; evalue=6.19e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990417

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770663.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770663.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770663.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770663.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17759808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B112
`Chr1:17759808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:17759864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr1:17759873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C16
`Chr1:17759877`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B77,C86
`Chr1:17759877`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B77,C86
`Chr1:17759879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A15,B125,B13,B133,B33,B48,B56,B65,B70,B87,B96,C28,C52,C54,C61,C62,C9,D2
`Chr1:17759885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C19,C82
`Chr1:17759885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C82
`Chr1:17759891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,C27,C72,D11
`Chr1:17759907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A23,B16,B27,B38,B39,B51,C12,C37,C5,C55,C64,C66,C77,C84,C86,D10
`Chr1:17759919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770663.1

312 aa

156

312

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 114-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770663.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	114	208	3.2e-19	70.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914680.1
ATGGGGGGAATGGATTTAGGGAGATGGTATTTTGAAAAACTGAAAAGGAAACTAGGAGATGGGAACCAAACCAAGTTCTGGGATCATGCGTGGGTGGGCGGGGAACCTCTGAAAGTCTCTTTCCCGAGGCTGTACCACCTAAGCAACAATAGGGAGGCTACTGTGGGCGAATCCGGAAGGTGGGAAGGGGGGAGCTGGGTCTGGGAATTGAAGTGGCGGAGGGATATCAGGGAAAGAGAGAGGGAGGCGGTGTCATCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990417
ATGGGGGGAATGGATTTAGGGAGATGGTATTTTGAAAAACTGAAAAGGAAACTAGGAGATGGGAACCAAACCAAGTTCTGGGATCATGCGTGGGTGGGCGGGGAACCTCTGAAAGTCTCTTTCCCGAGGCTGTACCACCTAAGCAACAATAGGGAGGCTACTGTGGGCGAATCCGGAAGGTGGGAAGGGGGGAGCTGGGTCTGGGAATTGAAGTGGCGGAGGGATATCAGGGAAAGAGAGAGGGAGGCGGTGTCATCACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770663.1
MGGMDLGRWYFEKLKRKLGDGNQTKFWDHAWVGGEPLKVSFPRLYHLSNNREATVGESGRWEGGSWVWELKWRRDIREREREAVSSLTSIIANFCPSAGIKDGWEWTEAADGKYTTKSAYDVIKSRRNENTHHTADNWRVAAVWKTPAPHKSAVTAWRLLRNRLLTCDNLRKRGVLLREEDQVCQQCNDQEETGSHLFTTCAKAQEIWDEIQKWCGINMARPASTAMHWEMFSHCGKNKKVRRLLQMIWIGCVWMLWKKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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