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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000760`

染色体: Chr06 坐标: 7031549-7034548 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000760`
名称	SmilChr06G000760
描述	uncharacterized SmilChr06G000760
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7031549 - 7034548 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990422`
GeneID	`130990422`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990422`
原始查询	`LOC130990422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.4; qcov=0.625; evalue=4.03e-52; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.2; qcov=0.667; evalue=2.37e-50; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990422

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770640.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770640.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770640.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770640.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770640.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7031555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr6:7031562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B128
`Chr6:7031574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A13,B100,B107,B117,B121,B122,B123,B13,B31,B34,B35,B44,B5,B85,B88,B9,C17,C27,C3,C33,C36,C45,C5,C74,C82
`Chr6:7031716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C40
`Chr6:7031728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr6:7031731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A21,A3,B1,B101,B105,B110,B122,B136,B140,B22,B33,B4,B60,B62,B64,B65,B82,B85,C12,C23,C31,C49,C5,C53,C55,C57,C59,C74,C79,C82,C83,C86,C9,D1,D9
`Chr6:7031768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:7031950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B55,B75,B78,C23
`Chr6:7031958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:7031993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr6:7031994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr6:7031999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770640.1

842 aa

421

842

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 384-483 aa PF10551 MULE 385-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770640.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	384	483	2.1e-10	40.8	Transposase, Mutator family
`XP_057770640.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	385	479	4.3e-20	72.6	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914657.1
ATGGTCGATTTTGCTGTACACGGTTGGGTTGAATATGATTTTGATGTTATTTTTAGCATGTTTGTATATTCAGTTGATGTATTGGGGTACACGATGTCATTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGCATAAGAAATATCCCGTTGTTTACGTGATCGAGAAGGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990422
ATGGTCGATTTTGCTGTACACGGTTGGGTTGAATATGATTTTGATGTTATTTTTAGCATGTTTGTATATTCAGTTGATGTATTGGGGTACACGATGTCATTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGCATAAGAAATATCCCGTTGTTTACGTGATCGAGAAGGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770640.1
MVDFAVHGWVEYDFDVIFSMFVYSVDVLGYTMSFQAIVIRHSGQWKLTEYEGGDEVVVYMSKEDLCHAKLMQEHKKYPVVYVIEKGKQSAAPVPQTQERVYYEGQRSTVFPIETDVGRSIPTHDDSRDDSSSQEEEDESESSDEEEEPDVEPRVGVQQLEARDWGIPVLDFDDAPALGWEDSNVLESGILSVGALFRSKDDLAIAVGLYHMENHVEYAVDRSSMTRLWFVCKLGNDCPFMLRAVQSASIWRVIKVVMDHT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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