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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000790`

染色体: Chr06 坐标: 7448176-7451152 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000790`
名称	SmilChr06G000790
描述	uncharacterized SmilChr06G000790
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7448176 - 7451152 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990428`
GeneID	`130990428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990428`
原始查询	`LOC130990428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0202300` - identity=32.2; qcov=0.427; evalue=5.89e-59; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770645.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770645.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770645.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770645.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7448182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B15,B50,B95,C81
`Chr6:7448182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B50,B95,C81
`Chr6:7448195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C80,D10
`Chr6:7448197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C61,D1
`Chr6:7448224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B31,B55,B99,C80
`Chr6:7448255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B29,C65,C82
`Chr6:7448274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	90	A1,A16,A2,A20,A22,A23,A3,A6,A7,B10,B100,B104,B105,B106,B109,B119,B122,B125,B135,B140,B15,B16,B2,B22,B24,B27,B33,B34,B36,B38,B39,B42,B48,B54,B56,B63,B71,B74,B75,B77,B78,B80,B82,B84,B85,B90,B92,B95,C13,C18,C2,C23,C26,C29,C33,C34,C35,C4,C42,C44,C47,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C7,C73,C76,C78,C79,C8,C81,C84,C85,C86,C9,D11,D2,D4,D7,D8,D9
`Chr6:7448289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	92	A1,A16,A2,A20,A22,A23,A3,A6,A7,B10,B100,B104,B105,B106,B109,B12,B122,B125,B130,B135,B140,B15,B16,B2,B22,B24,B25,B27,B34,B36,B38,B39,B42,B47,B48,B54,B56,B63,B71,B72,B74,B75,B77,B78,B80,B82,B84,B85,B90,B92,B94,B95,C13,C18,C2,C23,C26,C29,C33,C34,C35,C4,C42,C44,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C68,C7,C73,C76,C78,C79,C8,C81,C84,C85,C86,C9,D11,D2,D4,D7,D8,D9
`Chr6:7448290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C61,D3
`Chr6:7448291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr6:7448294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B22,B23,B31
`Chr6:7448322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770645.1

887 aa

444

887

RVT_1

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

RVT_3

PF00078 RVT_1 338-497 aa PF17919 RT_RNaseH_2 560-658 aa PF17917 RT_RNaseH 592-687 aa PF13456 RVT_3 717-806 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770645.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	338	497	2.9e-34	119.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057770645.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	560	658	5.3e-19	68.9	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057770645.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	592	687	9.9e-15	55.3	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057770645.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	717	806	9.1e-11	42.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914662.1
ATGGAGATTACAGATGTAGCAGAGGAGTCAACCATCACCTTCGGATCAGAGGATCTAAGAACGCTTATGTACCCCCACGACGATGCGCTGTTAATCACAGCCGACATAGCCAGTTGCATTGTCCATCGTGTTTTCGTAGATTCGGGCAGCGCAGTGAATATTCTATATCTGGAGTGTCTCCAGAACATGGGGATCGAAGCCAACATCGAGCCAACGAACGCTCCTTTATTCGGATTTGGGGGAGAAATGGTTATGCCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990428
ATGGAGATTACAGATGTAGCAGAGGAGTCAACCATCACCTTCGGATCAGAGGATCTAAGAACGCTTATGTACCCCCACGACGATGCGCTGTTAATCACAGCCGACATAGCCAGTTGCATTGTCCATCGTGTTTTCGTAGATTCGGGCAGCGCAGTGAATATTCTATATCTGGAGTGTCTCCAGAACATGGGGATCGAAGCCAACATCGAGCCAACGAACGCTCCTTTATTCGGATTTGGGGGAGAAATGGTTATGCCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770645.1
MEITDVAEESTITFGSEDLRTLMYPHDDALLITADIASCIVHRVFVDSGSAVNILYLECLQNMGIEANIEPTNAPLFGFGGEMVMPIGFVELSLSLGWADASKTRGIRFLVVDMPKPSYNVILGRPALTAFRAVISTFHLKMKFPIGGGRVGEVWGDQKMSKECHVRMLTHSSGQKRERSAEGPDTRKKGKVGDVAAPAEERRELTELLNDRDNTEKSALISTSDVCNMIELFPGREGFQTKIGSSMNEQIREELICCLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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