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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000847`

染色体: Chr06 坐标: 7995821-8008951 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000847`
名称	SmilChr06G000847
描述	protein ACCELERATED CELL DEATH 6-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7995821 - 8008951 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990440`
GeneID	`130990440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990440`
原始查询	`LOC130990440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ACCELERATED CELL DEATH 6-like
产物	protein ACCELERATED CELL DEATH 6-like
Arabidopsis	`AT3G18670` (AT3G18670) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821398] identity=34.5; qcov=0.863; evalue=7.52e-109; confidence=low
Rice	`Os08g0542700` - identity=31.1; qcov=0.263; evalue=6.07e-11; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13962 (PGG); PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770656.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770656.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770656.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770656.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770656.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7995977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B18,B55,B86,C44
`Chr6:7996125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:7996236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C85
`Chr6:7996324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:7996342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:8001895`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D3
`Chr6:8001895`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D3
`Chr6:8001913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B2
`Chr6:8002082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B2
`Chr6:8002087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B2
`Chr6:8002090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,C35,C64,C66,C81
`Chr6:8002108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770656.1

746 aa

373

746

Retrotran_gag_2

Ank_2

Ank

PGG

PF14223 Retrotran_gag_2 42-150 aa PF12796 Ank_2 130-222 aa PF12796 Ank_2 165-258 aa PF00023 Ank 196-223 aa PF13962 PGG 573-693 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770656.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	42	150	2.5e-11	44.3	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057770656.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	130	222	5.3e-16	59.7	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057770656.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	165	258	5.3e-16	59.7	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057770656.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	196	223	0.00015	22.6	Ankyrin repeat
`XP_057770656.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	573	693	1.4e-23	83.6	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914673.1
CAAAAATATAGTTGGAGTGGAGTGCGAATATAAATACGTTAGGTGATGAAAAGTTGAGGGATTGGGAAAAGAATGGGTTGTTCATCAGAATTGAAATACGCATGGCCTTGTAGTGTGAATGTACGTGTCTTCGTGACGGTGTGGCCGAGCGTGAAGGGATCTGGAAGAGGCAATTTCAAGAACTGGAAAGAGCAGATGGTTTGCCTGCTGGAGAGCCAGGACGTGGCGGGGTTTGTCGACGGTGAAATCGTGGCTCCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990440
ATGGGTTGTTCATCAGAATTGAAATACGCATGGCCTTGTAGTGTGAATGTACGTGTCTTCGTGACGGTGTGGCCGAGCGTGAAGGGATCTGGAAGAGGCAATTTCAAGAACTGGAAAGAGCAGATGGTTTGCCTGCTGGAGAGCCAGGACGTGGCGGGGTTTGTCGACGGTGAAATCGTGGCTCCGGAGAAACACGAGGCTGAGCAGTGGAAGCTGTGGAGAAGAACGGACAGGCTCGTCAAAGGATGGATTTTAGGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770656.1
MGCSSELKYAWPCSVNVRVFVTVWPSVKGSGRGNFKNWKEQMVCLLESQDVAGFVDGEIVAPEKHEAEQWKLWRRTDRLVKGWILGSVGADVLDAVRDKETARDVWLELDNIFKEDDDSESGDFSRYLALYQAAMKGDWDTAKKFFEDINELSSSIISSKKETVLHVAVLTGKANGLVKKLVEMMPLEALAHKDSNGETALHNAAIVGNTEAACVLVKKNPDLLHMSSNNNRLPVLEAAVNCQKETLEYLIAQHEANAER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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