当前解析结果
SmilChr06G000906| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000906 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000906 |
| 描述 | cysteine-rich receptor-like protein kinase 10 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 8537858 - 8538351 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990447 |
|---|---|
| GeneID | 130990447 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990447 |
| 原始查询 | LOC130990447 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cysteine-rich receptor-like protein kinase 10 |
| 产物 | cysteine-rich receptor-like protein kinase 10 |
| Arabidopsis | AT4G23180 (CRK10)cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828417] identity=46.9; qcov=0.695; evalue=1.91e-27; confidence=medium |
| Rice | Os04g0634500 (OsRLCK166)- identity=44.4; qcov=0.83; evalue=6.92e-31; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990447 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057770664.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057770664.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057770664.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057770664.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770664.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:8537902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr6:8537909 |
GGT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 24 | A15,A19,B101,B18,B24,B28,B30,B35,B62,B78,B93,C2,C32,C46,C52,C6,C68,C71,C75,C82,C85,D11,D4,D5 |
Chr6:8537912 |
T |
TAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 24 | A15,A19,B101,B18,B24,B28,B30,B35,B62,B78,B93,C2,C32,C46,C52,C6,C68,C71,C75,C82,C85,D11,D4,D5 |
Chr6:8537999 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B92,C72 |
Chr6:8538048 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B68,C45 |
Chr6:8538124 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr6:8538235 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。