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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000922`

染色体: Chr06 坐标: 8751317-8751787 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000922`
名称	SmilChr06G000922
描述	uncharacterized SmilChr06G000922
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8751317 - 8751787 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990451`
GeneID	`130990451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990451`
原始查询	`LOC130990451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=45.2; qcov=0.795; evalue=1.15e-23; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=55.1; qcov=0.885; evalue=2.56e-46; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770667.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770667.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770667.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770667.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770667.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8751342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B52,B53,C9
`Chr6:8751355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr6:8751410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B69
`Chr6:8751448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B32,B69
`Chr6:8751470`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A23,A8,B104,B118,B12,B124,B127,B128,B135,B16,B18,B2,B25,B26,B27,B35,B39,B42,B44,B51,B58,B63,B65,B67,B68,B69,B76,B80,B83,B87,B98,B99,C1,C11,C18,C21,C30,C37,C40,C49,C53,C54,C55,C62,C63,C69,C76,C8,C80,D10,D6,D8
`Chr6:8751538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B66,C19
`Chr6:8751544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:8751559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr6:8751564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:8751652`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C16,C78
`Chr6:8751652`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C16,C78
`Chr6:8751675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770667.1

156 aa

156

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 25-55 aa PF04827 Plant_tran 124-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770667.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	25	55	4.4e-14	52.7	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057770667.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	124	156	1.8e-07	31.7	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914684.1
ATGGAGATCCCGCTCCCCAAGCAAGAAGAAGGAACTATAACAGAGAACGCGAGATTGGCGAGCAACGTTCGATTTGTGGAAAGGCCGACGTATACTCCTCAGATTTTTCGACGTAGATTTCGCATGCAAAAAAAATTGTTTCTTCGTATAGTGGAGGCCATTACTGCCAATGACGAATATTTTCAACAAAGACCTGATGCCATAGGTAGACAAGGTTTATCACCGTTGGTGAAATGTACTGGAGCAATACGGGTGTTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990451
ATGGAGATCCCGCTCCCCAAGCAAGAAGAAGGAACTATAACAGAGAACGCGAGATTGGCGAGCAACGTTCGATTTGTGGAAAGGCCGACGTATACTCCTCAGATTTTTCGACGTAGATTTCGCATGCAAAAAAAATTGTTTCTTCGTATAGTGGAGGCCATTACTGCCAATGACGAATATTTTCAACAAAGACCTGATGCCATAGGTAGACAAGGTTTATCACCGTTGGTGAAATGTACTGGAGCAATACGGGTGTTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770667.1
MEIPLPKQEEGTITENARLASNVRFVERPTYTPQIFRRRFRMQKKLFLRIVEAITANDEYFQQRPDAIGRQGLSPLVKCTGAIRVLAYGSSTDVVDKFLRMSETVTGTSLIKFVEGVISCFGDEYLRRPNLARLLYVVEERGFPGIIGSIDCMHWE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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