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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000949`

染色体: Chr06 坐标: 9136268-9137211 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000949`
名称	SmilChr06G000949
描述	putative protein FAR1-RELATED SEQUENCE 10
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9136268 - 9137211 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990456`
GeneID	`130990456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990456`
原始查询	`LOC130990456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative protein FAR1-RELATED SEQUENCE 10
产物	putative protein FAR1-RELATED SEQUENCE 10
Arabidopsis	`AT3G07500` (AT3G07500) Far-red impaired responsive (FAR1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819938] identity=36.4; qcov=0.592; evalue=3.69e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0542200` - identity=45.3; qcov=0.408; evalue=1.11e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770673.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770673.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770673.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770673.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770673.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9136325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C30
`Chr6:9136342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C46
`Chr6:9136342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:9136427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C79
`Chr6:9136456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C47,D1
`Chr6:9136457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B57,B79
`Chr6:9136462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B57,B79,B94,D3
`Chr6:9136466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B57,B79,B94
`Chr6:9136509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B66,C19
`Chr6:9136514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B77,C29,C54
`Chr6:9136533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B23,B94,C44
`Chr6:9136558`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B118,B16,B63,B83,C56,C67,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770673.1

130 aa

130

FAR1

PF03101 FAR1 57-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770673.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	57	121	1.7e-08	35.8	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914690.1
TAAAACCGAGATGTCTGCCAACGGAAACAGAAAATCCAGGGTTTTCACACACTTCACGATATCAGTTCTTATCGACAATCCAGGCGTTCAAAATGGTGACCACTTATATATACCAGTTTGTGATGAATATGTGAAGCCGTTTGTTAGTCAAGTCTTCAAGTCTGAAGAAGATGCATTTCAGTTTTATAAGAAATACGAATATTCGTCTGGATTCGATGTTCGTAGAGAGTCCTCTAAGAAGGGGAAATATGGTCAAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990456
ATGTCTGCCAACGGAAACAGAAAATCCAGGGTTTTCACACACTTCACGATATCAGTTCTTATCGACAATCCAGGCGTTCAAAATGGTGACCACTTATATATACCAGTTTGTGATGAATATGTGAAGCCGTTTGTTAGTCAAGTCTTCAAGTCTGAAGAAGATGCATTTCAGTTTTATAAGAAATACGAATATTCGTCTGGATTCGATGTTCGTAGAGAGTCCTCTAAGAAGGGGAAATATGGTCAAATTATATATCGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770673.1
MSANGNRKSRVFTHFTISVLIDNPGVQNGDHLYIPVCDEYVKPFVSQVFKSEEDAFQFYKKYEYSSGFDVRRESSKKGKYGQIIYRHLVCAKEGINLGTHDEMSDAQPKKKKRRWKPSTRNTFAATLRSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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