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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000966`

染色体: Chr06 坐标: 9390904-9391656 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000966`
名称	SmilChr06G000966
描述	uncharacterized SmilChr06G000966
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9390904 - 9391656 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990461`
GeneID	`130990461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990461`
原始查询	`LOC130990461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=29.9; qcov=0.548; evalue=2.03e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.5; qcov=0.8; evalue=1.57e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770677.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770677.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770677.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770677.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770677.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9391062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	B1,B109,B114,B121,B128,B38,B4,B5,B50,B7,B78,B94,C1,C28,C31,C5,C61,C77
`Chr6:9391091`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B131,C59
`Chr6:9391091`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B131,C59
`Chr6:9391128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B29,B65,C27,C30
`Chr6:9391163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C59
`Chr6:9391173`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B131,C59
`Chr6:9391173`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B131,C59
`Chr6:9391182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A21,B130,B134,B61,B9,B92,C22,C3,C56
`Chr6:9391231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B65,C27
`Chr6:9391235`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A15,B109,B114,B23,B38,B4,B5,B50,B53,B65,B94,C24,C27,C28,C31,C46,C5,C61,C65
`Chr6:9391281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr6:9391294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B29,B59,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770677.1

250 aa

125

250

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770677.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	149	1.4e-19	71.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914694.1
ATGGGGAGATGGGTGGAAGGACAGTGGGTGTGGAATCTTGAATGGAGCCGTGCTTTGCTGGATAGAGAGAAAAAACAAGCAGATCTTCTTCTTTCATTTATCAACAACTTTCAGATAAATGAAGGAAAATTGGATTGTTGGAGATGGAAACTCTCGCCAGAGGGTCTCTTCACAGTCAAAACGGCATACAAAGCAATTTTCAATCAGGGGGCACCTCCCACCCAAAGCAAGAATGGGGTTTTCTCCACCATCTGGAATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990461
ATGGGGAGATGGGTGGAAGGACAGTGGGTGTGGAATCTTGAATGGAGCCGTGCTTTGCTGGATAGAGAGAAAAAACAAGCAGATCTTCTTCTTTCATTTATCAACAACTTTCAGATAAATGAAGGAAAATTGGATTGTTGGAGATGGAAACTCTCGCCAGAGGGTCTCTTCACAGTCAAAACGGCATACAAAGCAATTTTCAATCAGGGGGCACCTCCCACCCAAAGCAAGAATGGGGTTTTCTCCACCATCTGGAATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770677.1
MGRWVEGQWVWNLEWSRALLDREKKQADLLLSFINNFQINEGKLDCWRWKLSPEGLFTVKTAYKAIFNQGAPPTQSKNGVFSTIWNTPAMHKAKSTAWRIINGRIATCDNLLKRNVPIPNSEMLCVFCKTHNEDADHLFFSCQMSSEIWYNLFRWVGKQSALPSSAKAHFEVFINLGSKKEFGFLSGAWLCAVWCLWKQRNACRFNQVPWVKEKVITEIKTRLWGWQQIFSRSPPSRDFRFWFGAACVED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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