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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001017`

染色体: Chr06 坐标: 10072627-10076941 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001017`
名称	SmilChr06G001017
描述	uncharacterized SmilChr06G001017
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10072627 - 10076941 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990469`
GeneID	`130990469`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990469`
原始查询	`LOC130990469`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=25.5; qcov=0.429; evalue=7.69e-27; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=27.4; qcov=0.614; evalue=2.33e-41; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990469

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770683.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770683.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770683.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770683.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10072637`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A11,A8,B105,B113,B117,B127,B128,B132,B133,B18,B31,B41,B44,B45,B46,B50,B57,B64,B65,B8,B87,C11,C27,C3,C31,C39,C40,C56,C6,C65,C69,C7,C70,C71,C76,C77,C80,D8
`Chr6:10072644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10072658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10072692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr6:10072693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr6:10072695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10072698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10074078`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A25,B112,B114,B135,B65,B83,C10,D2
`Chr6:10074081`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A25,B112,B114,B135,B65,B83,C10,D2
`Chr6:10074198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:10074201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B86
`Chr6:10074204`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A6,B10,B103,B105,B134,B6,B62,B67,B83,C6,C76,C9,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770683.1

861 aa

430

861

RVT_1

PF00078 RVT_1 354-549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770683.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	354	549	1.7e-11	45.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914700.1
ATGGGAAGCACCGAGAAGGAGTCTTTGTGGGATGTATTACATTTCATTGCTCTTAAAAACAAAGACTCATGCCTGTGTATTCTTGGCGACTTCAATGCAGTGCGTGATCCGGGAGAAAGGGTGGGGAAAGGTGTTGTCTTCAACCAAGCAGATGCAAGGTTTTTTTACGCTTTCATTCGGCAAAGTAATCTGCTGGAAATCAGAACACAAGGGAGAAAGTTTACGTGGTATCAACCTAGTGGTGGATGCAAGAGCAAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990469
ATGGGAAGCACCGAGAAGGAGTCTTTGTGGGATGTATTACATTTCATTGCTCTTAAAAACAAAGACTCATGCCTGTGTATTCTTGGCGACTTCAATGCAGTGCGTGATCCGGGAGAAAGGGTGGGGAAAGGTGTTGTCTTCAACCAAGCAGATGCAAGGTTTTTTTACGCTTTCATTCGGCAAAGTAATCTGCTGGAAATCAGAACACAAGGGAGAAAGTTTACGTGGTATCAACCTAGTGGTGGATGCAAGAGCAAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770683.1
MGSTEKESLWDVLHFIALKNKDSCLCILGDFNAVRDPGERVGKGVVFNQADARFFYAFIRQSNLLEIRTQGRKFTWYQPSGGCKSKLDRFLVNERWMQEWPDTVGRGLQRSVSDHCPIFLTTKTKNWGPKPFRFLNSWLSHPDFSELVRKTWDEAKIEGWSCFVFKEKLKLIKFALKEWNLRIYGNIEHGLTELKDELQELDIIDDTFGLDESETIRRNELRAKIILKSKEKCSLLQQKAKVKWVKEGDLDTSFYHKAIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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