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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001058`

染色体: Chr06 坐标: 10432657-10433193 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001058`
名称	SmilChr06G001058
描述	uncharacterized SmilChr06G001058
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10432657 - 10433193 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990474`
GeneID	`130990474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990474`
原始查询	`LOC130990474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=26.7; qcov=0.82; evalue=4.51e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=29.3; qcov=0.843; evalue=5.15e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770688.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057770688.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770688.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770688.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10432657`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A18,B73,B9
`Chr6:10432657`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A18,B73,B9
`Chr6:10432706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B71,D1
`Chr6:10432714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr6:10432756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C31
`Chr6:10432760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B68,B69,C22
`Chr6:10432777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B57,B71,C31,C82
`Chr6:10432780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C83
`Chr6:10432780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:10432829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A1,A10,A11,A15,A22,A23,A3,A4,B106,B107,B110,B125,B132,B135,B139,B14,B15,B19,B23,B24,B27,B33,B48,B49,B52,B56,B57,B59,B68,B7,B73,B81,B88,B89,B9,B96,B97,B98,C1,C10,C2,C20,C29,C32,C4,C41,C44,C51,C58,C6,C64,C68,C79,D4,D9
`Chr6:10432835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr6:10432857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B129,B2,C33,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770688.1

178 aa

178

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 5-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770688.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	5	77	5.4e-17	62.9	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914705.1
ATGACCGAACGTAGGGAAGAAAATGAATTTGCACTGATTTGGAAAACTCCGGCATCTGCAACAGCAATCACTACGGCATGGAAAGTTTTGAAAGGACGTTTGCCTACGGTCGACAATCTCCGAAGAAGACAGGTGGTTTTACAGCCAGCAGCCTGCTGTGTGCTCTGCAACTCGAGTGAAGAATCAATCGATCATCTCTTCTTCTCTTGTCATAAGTCAGACGAAATTTGGAAGAGTATTTTTCTCTGGATTGATAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990474
ATGACCGAACGTAGGGAAGAAAATGAATTTGCACTGATTTGGAAAACTCCGGCATCTGCAACAGCAATCACTACGGCATGGAAAGTTTTGAAAGGACGTTTGCCTACGGTCGACAATCTCCGAAGAAGACAGGTGGTTTTACAGCCAGCAGCCTGCTGTGTGCTCTGCAACTCGAGTGAAGAATCAATCGATCATCTCTTCTTCTCTTGTCATAAGTCAGACGAAATTTGGAAGAGTATTTTTCTCTGGATTGATAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770688.1
MTERREENEFALIWKTPASATAITTAWKVLKGRLPTVDNLRRRQVVLQPAACCVLCNSSEESIDHLFFSCHKSDEIWKSIFLWIDKQSVCHTKAKNHLNAFINLGNKDDLSFLLQVWIGTVWCIWKWRNDCIFNQGNWNKERVVSEIKAKIWSWLLAFNLPKSPAVFNRWFNVVSLLG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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