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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001097`

染色体: Chr06 坐标: 10977281-10980415 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001097`
名称	SmilChr06G001097
描述	uncharacterized SmilChr06G001097
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10977281 - 10980415 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990481`
GeneID	`130990481`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990481`
原始查询	`LOC130990481`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=37.1; qcov=0.134; evalue=1.34e-21; confidence=weak
Rice	`Os08g0202300` - identity=34.9; qcov=0.455; evalue=1.76e-77; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990481

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770694.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770694.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770694.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770694.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10977473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C46,C69
`Chr6:10977481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C72
`Chr6:10977496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B44
`Chr6:10977514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A5,B131,B44
`Chr6:10977523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:10977530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,D4,D5
`Chr6:10977548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	C10,C9,D4,D5
`Chr6:10977548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C10,C9,D4,D5
`Chr6:10977568`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A1,A20,A7,B111,B121,B122,B129,B140,B15,B21,B23,B29,B32,B47,B5,B52,B55,B56,B6,B70,B71,B85,B88,B90,B92,B96,C13,C15,C25,C36,C57,C60,C62,C67,C75,C84
`Chr6:10977576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C87
`Chr6:10977616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C10
`Chr6:10977622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770694.1

988 aa

494

988

RVT_1

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF00078 RVT_1 562-716 aa PF17919 RT_RNaseH_2 781-877 aa PF17917 RT_RNaseH 805-908 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770694.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	562	716	5e-30	105.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057770694.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	781	877	5.1e-32	110.6	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057770694.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	805	908	4.8e-35	120.6	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914711.1
TTCAATTTATAGGCTGAAATCATGAACTGTTAGCCGCAAAGCTTGAAAATAAATTGCAGCAAAAGTGGAAAAAGTTTGCAGCCTTTTTTTTCTTTTTGACTATTGCAGCCACAATAGTTGAATGGAGTGTTGCTGCCTCTTTTTGACTAACACAAGTCCGACGAGAGGATGGAGAAGTTGGAGTCCAATGCTGTTGCTGTGGGGACCCAGATGAAGATGTTCGAGACCCAATTGGGTCAACTGGCCAATGCTTTTACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990481
ATGGAGAAGTTGGAGTCCAATGCTGTTGCTGTGGGGACCCAGATGAAGATGTTCGAGACCCAATTGGGTCAACTGGCCAATGCTTTTACAAATCTACACCAACAAGGTCAGTTTTCGAGCAATACAACTGTTAATCCCAAGGAGCATTGCAAGGCAATCAATTTGAGGAGTGGGACTACTTATGAGGTACCCAAGATGCCTGAGGACGAGATCGTGTCACCGGTTGATGAGAAAGAAGCTGAGGAGGTCACCGTTGAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770694.1
MEKLESNAVAVGTQMKMFETQLGQLANAFTNLHQQGQFSSNTTVNPKEHCKAINLRSGTTYEVPKMPEDEIVSPVDEKEAEEVTVEVSGKKKNEKQKTTSPATVTLPFPQRHQKERVKQQFSKFLEIFKKLHINLPLVEALQEMPQYAKFLKDIISRKKRLGEFETVNLNEECSAILQKKLPAKLKDPGIFTISCIIGGQQFGKALCDLGASINLMPLSIFQRLAIGEMKPTSIALQMADRSVTYPRGIVEDMLVKVNEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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