当前解析结果
SmilChr06G001098| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001098 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001098 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001098 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 10988677 - 10989454 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990482 |
|---|---|
| GeneID | 130990482 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990482 |
| 原始查询 | LOC130990482 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990482 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770695.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057770695.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770695.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770695.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770695.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:10988700 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,C27 |
Chr6:10988827 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:10988840 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 20 | A4,A6,B1,B100,B119,B138,B34,B48,B50,B58,B7,B79,B85,B91,B94,C15,C17,C26,C47,C7 |
Chr6:10988846 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B96 |
Chr6:10988888 |
CAA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 18 | A20,A21,B105,B112,B113,B130,B132,B133,B31,B57,B65,B8,B84,C3,C39,C7,C77,C79 |
Chr6:10988918 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
Chr6:10988967 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B59,B67,C13,C4,C46 |
Chr6:10989000 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B59,B67,C10,C13,C4 |
Chr6:10989020 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,B28,C24 |
Chr6:10989021 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B99,C30 |
Chr6:10989293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B25,C49,C9 |
Chr6:10989304 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 57 | A11,A21,A7,B100,B106,B108,B11,B113,B114,B130,B131,B133,B137,B14,B16,B17,B22,B23,B36,B38,B39,B5,B53,B56,B57,B58,B65,B7,B71,B73,B82,B95,B96,C17,C18,C2,C23,C24,C29,C3,C32,C35,C36,C39,C47,C51,C56,C57,C64,C73,C78,C79,C84,C9,D3,D5,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。