当前解析结果
SmilChr06G001192| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001192 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001192 |
| 描述 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 12182339 - 12185048 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990500 |
|---|---|
| GeneID | 130990500 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990500 |
| 原始查询 | LOC130990500 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| 产物 | vegetative cell wall protein gp1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990500 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770711.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057770711.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770711.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770711.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770711.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:12182512 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr6:12182660 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,B73,C57 |
Chr6:12182699 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B140,B39,B6 |
Chr6:12182739 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,B43,C18,D5 |
Chr6:12182782 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr6:12182800 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 19 | A1,A16,A5,B111,B13,B133,B139,B37,B54,B58,B67,B73,B80,B88,B90,C14,C30,C33,C66 |
Chr6:12182806 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr6:12182808 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,C19,C4 |
Chr6:12182815 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,C12,C27 |
Chr6:12182831 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,C85 |
Chr6:12182833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B13,B94 |
Chr6:12182842 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。