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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001210`

染色体: Chr06 坐标: 12386791-12389513 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001210`
名称	SmilChr06G001210
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12386791 - 12389513 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990502`
GeneID	`130990502`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990502`
原始查询	`LOC130990502`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=53.6; qcov=0.327; evalue=2.82e-35; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=54.2; qcov=1; evalue=2.29e-131; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990502

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770713.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057770713.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770713.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770713.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770713.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12386795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C17,C82,C9
`Chr6:12386818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B49,C21
`Chr6:12386826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,C3,C63
`Chr6:12386827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr6:12386829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B26,B60
`Chr6:12386834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:12386835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B136,B72,C10,C55
`Chr6:12386854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,C21,C34,C50
`Chr6:12386856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr6:12386858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B119,C44
`Chr6:12386859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,C38,C5
`Chr6:12386869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770713.1

343 aa

172

343

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 82-285 aa PF13359 DDE_Tnp_4 113-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770713.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	82	285	2e-94	315.6	Plant transposon protein
`XP_057770713.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	113	276	1.2e-08	35.4	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914730.1
ATGCGTCGTGCGTTGTTTTTGCACATCGTTAATGCCGTCGCAGCCGATCCATACTTCCAACAACGCACGGATGCACTAGGGAGGCCTGGCTTCACGCCATTGCAAAAATGCACTGTCGCTGTTCGTATGCTAGCTAACGGTGGGGCAGCGGACCAATACGACGAGTATCTCCGGATTGTTGAGTCCACCGCGTTGGAGTGCTTGCGCAGATTCAGTCAAGCTATTATTCAACTCTTCGGTGCGGAGTACTTGAGGAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990502
ATGCGTCGTGCGTTGTTTTTGCACATCGTTAATGCCGTCGCAGCCGATCCATACTTCCAACAACGCACGGATGCACTAGGGAGGCCTGGCTTCACGCCATTGCAAAAATGCACTGTCGCTGTTCGTATGCTAGCTAACGGTGGGGCAGCGGACCAATACGACGAGTATCTCCGGATTGTTGAGTCCACCGCGTTGGAGTGCTTGCGCAGATTCAGTCAAGCTATTATTCAACTCTTCGGTGCGGAGTACTTGAGGAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770713.1
MRRALFLHIVNAVAADPYFQQRTDALGRPGFTPLQKCTVAVRMLANGGAADQYDEYLRIVESTALECLRRFSQAIIQLFGAEYLRRPTSADCQQLLAMHEAKHGFPGMLGSLDCMHWAWKNCPTAWQGAYTRGDQGEPTIILEVVASQDLWIWHAFFGTPGSNNDINVLNNSTLFNDRLQGMGVPVTYQVNNTYYTSWYYLTDGIYPNWPVFVKSLTHPTDPKGKRFKVMQEAARKDIERAFGVLQARWAIVKGPARLWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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