当前解析结果
SmilChr06G001236| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001236 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001236 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001236 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 12745874 - 12748240 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990506 |
|---|---|
| GeneID | 130990506 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990506 |
| 原始查询 | LOC130990506 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990506 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770718.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057770718.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057770718.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770718.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770718.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:12745961 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr6:12746078 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B63,C85,C9 |
Chr6:12746085 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr6:12746090 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B71,C10,D7 |
Chr6:12746093 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A15,B3,B32 |
Chr6:12746093 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A15,B3,B32 |
Chr6:12746101 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B26,B43,C15,C87 |
Chr6:12746103 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,D8 |
Chr6:12746117 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr6:12746202 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B104,B108,B82,B97,C17,C23,C68 |
Chr6:12746204 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B48,B75,C21 |
Chr6:12746208 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,C23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。