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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001251`

染色体: Chr06 坐标: 13002075-13004177 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001251`
名称	SmilChr06G001251
描述	uncharacterized SmilChr06G001251
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13002075 - 13004177 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990510`
GeneID	`130990510`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990510`
原始查询	`LOC130990510`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=31.7; qcov=1.04; evalue=2e-58; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990510

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770723.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770723.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770723.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770723.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770723.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13002086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B73,C31,C51
`Chr6:13002229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr6:13002243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B137,C64,C66
`Chr6:13002253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A9,C19
`Chr6:13002275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B78
`Chr6:13002276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,C77
`Chr6:13002289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C42,C64,D2
`Chr6:13002291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B18,B5,B50
`Chr6:13002312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B102,B107,B119,B126
`Chr6:13002318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B124,C33,C39
`Chr6:13002318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C33,C39
`Chr6:13002325`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A16,B103,B110,B113,B128,B132,B135,B137,B19,B20,B22,B29,B35,B38,B39,B49,B56,B60,B66,B72,B9,B96,C2,C22,C24,C28,C33,C43,C49,C52,C53,C82,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770723.1

381 aa

190

381

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 5-81 aa PF02992 Transposase_21 291-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770723.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	81	7.5e-20	71.6	Transposase-associated domain
`XP_057770723.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	291	374	2.5e-35	122.3	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914740.1
GCCGGTCGCCGCCGTCGCCTCCGTCAAGGCCAATCCTGCCGTCTCACCGCTCCTGCCACCGCACGGTTCCGCCGTCGACTCCTACGAATTTGCAAGAATGAGTGATAATCGATCGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTGCTGCATTTGAAACGGGACTTGAGAGTTTCCTCGAGTTTGCGATAAATCAAACAGCGTATATAGATGGAATTGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAGGAAGTGTAAGAATAAAGTATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990510
ATGAGTGATAATCGATCGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTGCTGCATTTGAAACGGGACTTGAGAGTTTCCTCGAGTTTGCGATAAATCAAACAGCGTATATAGATGGAATTGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAGGAAGTGTAAGAATAAAGTATTTGCATCTGTACCTACAGTCAGAGAACATGTTACTAGGCGTGGATTTGTCCACAATTACACGAACTGGTGTTATCAAGGGGAAGCACCAGTGTATATGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770723.1
MSDNRSWMYARYNDRAAFETGLESFLEFAINQTAYIDGIGNIRCPCRKCKNKVFASVPTVREHVTRRGFVHNYTNWCYQGEAPVYMPAEHTIMDEDDGSYSNYQRMVHDHAGPSNYQDPPNLEEPPNPDAQQIYDMLNAADSPLYPDCDTYSQLSWMTQMISIKVENHMSERCFNQISEMVQKALPKDNNCPDSFYSTKRNLRGLGLPVEKIDCCVNNCMLYWGDDSELESCNFYGASRYKENLRASGSRRKKRVAAKQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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