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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001305`

染色体: Chr06 坐标: 13568963-13569841 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001305`
名称	SmilChr06G001305
描述	uncharacterized SmilChr06G001305
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13568963 - 13569841 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990526`
GeneID	`130990526`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990526`
原始查询	`LOC130990526`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=26.5; qcov=0.801; evalue=1.14e-22; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=29.7; qcov=0.945; evalue=2.69e-32; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990526

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770736.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770736.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770736.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770736.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770736.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13568969`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	208	A1,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B17,B18,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B78,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B90,B91,B92,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr6:13569018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B15,B89,C10,C72
`Chr6:13569084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A1,A13,A15,A18,A23,A6,B100,B104,B109,B11,B112,B121,B125,B128,B130,B131,B22,B24,B40,B49,B51,B57,B60,B66,B76,B79,B8,B88,B89,B9,B94,B97,C11,C14,C2,C23,C24,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C35,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C47,C49,C50,C51,C55,C57,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C79,C8,C80,D9
`Chr6:13569090`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A10,B1,B100
`Chr6:13569090`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A10,B1,B100
`Chr6:13569110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B83,C27
`Chr6:13569137`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A23
`Chr6:13569137`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A23
`Chr6:13569151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A10,B108,B46,B47,B72,C32,C47,C68,C78
`Chr6:13569166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B128,B20
`Chr6:13569166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B20
`Chr6:13569188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B65,B71,C49,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770736.1

292 aa

146

292

DBD_Tnp_Mut

PF03108 DBD_Tnp_Mut 62-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770736.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	62	120	1.2e-08	35.2	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914753.1
ATGGAAGCAGAGGTGAATGAGGGTGAGAGTGAAAGAGAAGAGGGCATGGATAATGACAGAGATGAGGGGGTGATTAGTGATGATGACTCTAGTGTTTACCGTGGTCATTTAAATGAGAGTGAGGTTGATGAGCAAGAAGTAGAGCAAGTGATGGTTACTGTAGAGGATGGGGAGGAGGGTAGATTTCAGTTGGGGCAGACCTTTGCTGGGGCAAAGAAAGCTAGAGAGGCCATCAATTCATATGGTGTGAAGTTTGGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990526
ATGGAAGCAGAGGTGAATGAGGGTGAGAGTGAAAGAGAAGAGGGCATGGATAATGACAGAGATGAGGGGGTGATTAGTGATGATGACTCTAGTGTTTACCGTGGTCATTTAAATGAGAGTGAGGTTGATGAGCAAGAAGTAGAGCAAGTGATGGTTACTGTAGAGGATGGGGAGGAGGGTAGATTTCAGTTGGGGCAGACCTTTGCTGGGGCAAAGAAAGCTAGAGAGGCCATCAATTCATATGGTGTGAAGTTTGGTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770736.1
MEAEVNEGESEREEGMDNDRDEGVISDDDSSVYRGHLNESEVDEQEVEQVMVTVEDGEEGRFQLGQTFAGAKKAREAINSYGVKFGYKIKFVKNEKTRIRVVCMNEKECPFLKHVSKDGDAEGLVIKTLILEHTCCKQREVPSASQGYLAKYFKQAVYRNPKYTSKDMQGHVKDHLKLHVSLAKCKWAKKEIICNLEGSYKEEFSRLCAYIEKVKECMPGSRLELQLSTEQLQAGNRVFKRLFVMLEPCRLNWLGGCRKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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